More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2779 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  45.88 
 
 		 2232 aa  686    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  54.49 
 
 		 1820 aa  902    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  59.84 
 
 		 1601 aa  1719    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  35.18 
 
 		 1537 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  54.83 
 
 		 6768 aa  1442    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  100 
 
 		 1584 aa  3103    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  38.17 
 
 		 2880 aa  781    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  56.64 
 
 		 4151 aa  966    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  32.72 
 
 		 1559 aa  795    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 		 2230 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  52.63 
 
 		 3508 aa  899    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  52.84 
 
 		 1602 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  48.98 
 
 		 2719 aa  783    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.67 
 
 		 2066 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.24 
 
 		 3148 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  60.24 
 
 		 7210 aa  984    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  52.06 
 
 		 2113 aa  806    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  53.75 
 
 		 1143 aa  870    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  37.59 
 
 		 1822 aa  699    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  54.56 
 
 		 4607 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  48.95 
 
 		 1071 aa  725    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.77 
 
 		 2551 aa  739    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.32 
 
 		 1874 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  43.48 
 
 		 1573 aa  940    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 		 1144 aa  669    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.83 
 
 		 1587 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  45.93 
 
 		 3254 aa  1135    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.4 
 
 		 1816 aa  763    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.26 
 
 		 3493 aa  1234    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  58.17 
 
 		 3408 aa  1025    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.47 
 
 		 3874 aa  879    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  43.25 
 
 		 1955 aa  999    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  56.75 
 
 		 2108 aa  979    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  57.88 
 
 		 5255 aa  923    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.81 
 
 		 2762 aa  690    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  50.45 
 
 		 2374 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  63.37 
 
 		 3033 aa  1714    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  52.09 
 
 		 4111 aa  863    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.09 
 
 		 2081 aa  1024    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  56.88 
 
 		 2966 aa  941    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  43.32 
 
 		 3176 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.15 
 
 		 2078 aa  687    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  57.42 
 
 		 1789 aa  949    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  43.98 
 
 		 3281 aa  1001    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  56.27 
 
 		 3670 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 3693 aa  807    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  49.94 
 
 		 2376 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 1520 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.66 
 
 		 1559 aa  793    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 1580 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.25 
 
 		 1101 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  47.11 
 
 		 7279 aa  1094    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  47.13 
 
 		 3449 aa  1179    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  40.78 
 
 		 1939 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.09 
 
 		 4080 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1354 aa  637    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.23 
 
 		 1909 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  57.16 
 
 		 3494 aa  925    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  51.12 
 
 		 4840 aa  758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  53.99 
 
 		 4930 aa  848    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  56.61 
 
 		 2846 aa  894    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  53.7 
 
 		 2090 aa  855    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  50.44 
 
 		 2367 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.66 
 
 		 2107 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53 
 
 		 3092 aa  1376    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.33 
 
 		 3693 aa  807    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.91 
 
 		 3463 aa  814    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.36 
 
 		 1520 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46.5 
 
 		 4882 aa  698    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  36.57 
 
 		 1580 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  45.69 
 
 		 4183 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.43 
 
 		 1548 aa  1096    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.64 
 
 		 3676 aa  777    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  51.91 
 
 		 3930 aa  868    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 		 3696 aa  807    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  53.29 
 
 		 2020 aa  830    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.34 
 
 		 1305 aa  856    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  43.88 
 
 		 2136 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.65 
 
 		 1581 aa  659    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  40.03 
 
 		 3400 aa  638    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  55.9 
 
 		 1831 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  52.25 
 
 		 1924 aa  818    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.3 
 
 		 5400 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  51.23 
 
 		 1114 aa  920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  50.87 
 
 		 3711 aa  802    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.45 
 
 		 7110 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.47 
 
 		 1593 aa  1306    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.56 
 
 		 2024 aa  923    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  57.31 
 
 		 2126 aa  984    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  57.76 
 
 		 3355 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 3702 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  51.05 
 
 		 5154 aa  1301    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 		 1837 aa  739    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  36.1 
 
 		 1580 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  54.03 
 
 		 2277 aa  912    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  49.73 
 
 		 2060 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  44.72 
 
 		 3158 aa  1075    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.15 
 
 		 1867 aa  887    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.11 
 
 		 2847 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  56.28 
 
 		 4575 aa  827    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>