More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2778 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  33.91 
 
 		 3645 aa  849    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 3711 aa  7228    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  47.1 
 
 		 3158 aa  1117    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  51.41 
 
 		 7210 aa  2980    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 		 3092 aa  1132    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.61 
 
 		 1402 aa  648    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  47.19 
 
 		 1114 aa  763    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  49.89 
 
 		 1602 aa  1103    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  50.87 
 
 		 1584 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  64.33 
 
 		 4840 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  40.84 
 
 		 3176 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.26 
 
 		 2880 aa  748    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  42.66 
 
 		 2719 aa  1004    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  41.31 
 
 		 2066 aa  1238    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  45.22 
 
 		 2277 aa  1233    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  68.45 
 
 		 3033 aa  1625    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.3 
 
 		 1867 aa  1338    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  46.72 
 
 		 2024 aa  766    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  42.56 
 
 		 4111 aa  1938    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  47.03 
 
 		 1820 aa  1269    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  53.92 
 
 		 4080 aa  2325    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.79 
 
 		 2551 aa  686    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 		 1874 aa  949    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.16 
 
 		 1656 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  51.89 
 
 		 2966 aa  1810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  40.68 
 
 		 1587 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.98 
 
 		 2847 aa  1231    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  49.36 
 
 		 1831 aa  1367    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  32.87 
 
 		 1939 aa  801    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  46.53 
 
 		 1924 aa  1215    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  43.91 
 
 		 2020 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  54.04 
 
 		 3254 aa  1162    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  45.64 
 
 		 2090 aa  1348    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  44.89 
 
 		 4930 aa  2249    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  31.86 
 
 		 1876 aa  641    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  50.01 
 
 		 3494 aa  2742    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.98 
 
 		 1071 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  48.77 
 
 		 2081 aa  831    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  30.51 
 
 		 3111 aa  687    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  43.23 
 
 		 4607 aa  843    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  36.37 
 
 		 2232 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.62 
 
 		 7110 aa  2810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  51.61 
 
 		 4151 aa  1457    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 1559 aa  678    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  35.3 
 
 		 3693 aa  867    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.02 
 
 		 1349 aa  662    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  48.21 
 
 		 2107 aa  1263    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.54 
 
 		 3874 aa  1495    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.03 
 
 		 7279 aa  2581    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  47.34 
 
 		 4575 aa  1368    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  36.97 
 
 		 4183 aa  910    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  47.93 
 
 		 6768 aa  1222    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  31.96 
 
 		 2551 aa  641    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  47.64 
 
 		 2113 aa  1263    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  39.29 
 
 		 1354 aa  658    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  48.37 
 
 		 3670 aa  1466    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  48.6 
 
 		 2126 aa  1060    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.04 
 
 		 2230 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  51.66 
 
 		 1955 aa  880    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.13 
 
 		 4478 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  40.51 
 
 		 3449 aa  1269    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  50.9 
 
 		 2376 aa  834    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  35.3 
 
 		 3693 aa  867    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  43.77 
 
 		 3508 aa  2292    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  51.12 
 
 		 3408 aa  2082    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  45.94 
 
 		 3148 aa  1319    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  50.17 
 
 		 1789 aa  1409    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 		 5400 aa  3557    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.75 
 
 		 1804 aa  751    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  36.27 
 
 		 3676 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46 
 
 		 4882 aa  2174    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.79 
 
 		 3696 aa  831    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  44.74 
 
 		 3493 aa  1310    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  33.46 
 
 		 1805 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  44.98 
 
 		 3400 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.77 
 
 		 1816 aa  1533    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  32.36 
 
 		 1828 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  51.17 
 
 		 1601 aa  761    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  44.62 
 
 		 3930 aa  1533    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 		 3101 aa  691    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.02 
 
 		 1822 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  73.99 
 
 		 3463 aa  4507    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  51.64 
 
 		 2367 aa  1168    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  55.31 
 
 		 1548 aa  904    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  34.08 
 
 		 1827 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  48.21 
 
 		 5154 aa  2167    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  50.47 
 
 		 2060 aa  1053    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 3702 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  34.93 
 
 		 1349 aa  660    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  51.17 
 
 		 1593 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  48.97 
 
 		 1143 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  52.39 
 
 		 3355 aa  1794    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.55 
 
 		 1559 aa  675    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  35.91 
 
 		 1832 aa  781    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  49.06 
 
 		 5255 aa  2666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  52.13 
 
 		 2374 aa  854    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 		 3679 aa  849    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  45.26 
 
 		 2846 aa  1191    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.47 
 
 		 1837 aa  1164    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  33.43 
 
 		 1806 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>