More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2775 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2688  AMP-dependent synthetase and ligase  70.64 
 
 		 529 aa  732    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2775  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1088    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143385  decreased coverage  0.00095166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0555  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 		 534 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000001061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0542  amino acid adenylation domain protein  34.77 
 
 		 534 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.404103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  29.83 
 
 		 541 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  30.43 
 
 		 983 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17200  non-ribosomal peptide synthase  31.38 
 
 		 504 aa  209  9e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.699646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  29.8 
 
 		 1518 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1466  amino acid adenylation domain-containing protein  26.9 
 
 		 494 aa  206  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  30 
 
 		 1518 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.38 
 
 		 2370 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0415  amino acid adenylation domain-containing protein  26.68 
 
 		 502 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  29.81 
 
 		 1317 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 		 2386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  30.7 
 
 		 522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  29.02 
 
 		 1518 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  31.98 
 
 		 1334 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.31 
 
 		 8646 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.15 
 
 		 6176 aa  201  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  31.86 
 
 		 5469 aa  200  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 		 2845 aa  200  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.01 
 
 		 2385 aa  200  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.36 
 
 		 1042 aa  200  6e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.3 
 
 		 2385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.3 
 
 		 2385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  32.26 
 
 		 2573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.08 
 
 		 2385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.6 
 
 		 2154 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  31.8 
 
 		 4383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.08 
 
 		 2385 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7311  peptide synthetase  31.18 
 
 		 2183 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  29.86 
 
 		 2151 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1311  conserved hypothetical protein, putative amino acid adenylation domain protein  27.29 
 
 		 498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000252805  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  29.32 
 
 		 3291 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.6 
 
 		 13537 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.82 
 
 		 1833 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  30.54 
 
 		 923 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.11 
 
 		 2385 aa  196  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3056  enterobactin synthase subunit F  31.76 
 
 		 1310 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.6 
 
 		 7310 aa  196  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  31.14 
 
 		 5926 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  31.53 
 
 		 3639 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.92 
 
 		 2385 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  32.7 
 
 		 1769 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3873  amino acid adenylation domain protein  32.44 
 
 		 5698 aa  194  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.166545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  29.75 
 
 		 2193 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.31 
 
 		 2666 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  31.26 
 
 		 2883 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1496  amino acid adenylation domain-containing protein  26.29 
 
 		 502 aa  194  5e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.283025  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.67 
 
 		 5929 aa  193  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  31.1 
 
 		 2151 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0624  amino acid adenylation domain protein  31.89 
 
 		 1693 aa  193  6e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.722772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  30.74 
 
 		 2606 aa  193  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  27.31 
 
 		 1336 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.36 
 
 		 2385 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  36.15 
 
 		 2333 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  32.02 
 
 		 7712 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  33.33 
 
 		 4290 aa  192  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  31.38 
 
 		 5467 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  29.88 
 
 		 1454 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  32.06 
 
 		 2187 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  31.97 
 
 		 1449 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 		 1405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.64 
 
 		 3208 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1907  amino acid adenylation domain-containing protein  28.16 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 533 aa  191  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.62 
 
 		 3404 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0562  BarD  29.66 
 
 		 565 aa  190  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1337  amino acid adenylation domain protein  33.11 
 
 		 1158 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.34 
 
 		 2385 aa  190  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  29.85 
 
 		 2273 aa  190  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  30.67 
 
 		 5230 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2462  amino acid adenylation domain-containing protein  29.98 
 
 		 529 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  32.74 
 
 		 4991 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  31.19 
 
 		 2875 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0899  BarD  29.79 
 
 		 602 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  28.74 
 
 		 6202 aa  190  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4801  hypothetical protein  30.31 
 
 		 2167 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.12 
 
 		 4747 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1762  amino acid adenylation domain protein  32.94 
 
 		 2258 aa  189  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0992147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  30.65 
 
 		 923 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0368  amino acid adenylation domain-containing protein  27.29 
 
 		 1194 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  30.65 
 
 		 3021 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.32 
 
 		 2571 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  29.49 
 
 		 1550 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2655  amino acid adenylation domain-containing protein  32.37 
 
 		 1321 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.326084  normal  0.533247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.32 
 
 		 2571 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5386  non-ribosomal peptide synthetase  34.04 
 
 		 1318 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123058 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1322  amino acid adenylation domain-containing protein  25.23 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.83 
 
 		 9498 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  30.83 
 
 		 5372 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  28.9 
 
 		 1142 aa  188  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  33.96 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  31.94 
 
 		 2651 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2598  amino acid adenylation domain-containing protein  29.98 
 
 		 529 aa  189  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  28.99 
 
 		 4968 aa  188  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  31.85 
 
 		 1137 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  28.27 
 
 		 2581 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  31.59 
 
 		 923 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 538 aa  187  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>