46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2755 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  100 
 
 
225 aa  453  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  41.58 
 
 
193 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  35.75 
 
 
232 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  39.46 
 
 
198 aa  98.6  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  37.43 
 
 
193 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  32.47 
 
 
192 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  36.22 
 
 
196 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.52 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  35.83 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.81 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  32.52 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  32.78 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  29.63 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  32.46 
 
 
201 aa  82.4  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 
180 aa  82  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.75 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  32.5 
 
 
230 aa  78.6  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  32 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  32.62 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  36.42 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.3 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  30.48 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  33.99 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  30.68 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 
195 aa  62.4  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  34.72 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
182 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
187 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  26.37 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0212  regulatory protein ArsR  35.33 
 
 
201 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  26.74 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  33.65 
 
 
183 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  25.97 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  30.65 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 
120 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
197 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
102 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>