21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2745 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  307  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  57.43 
 
 		 248 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  46.75 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  53.73 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  55.26 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  50 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  41.89 
 
 		 220 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  41.79 
 
 		 223 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  41.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  41.79 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  41.79 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  43.28 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  40.3 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  57.41 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  38.67 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  61.11 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  41.1 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  41.77 
 
 		 208 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  48.94 
 
 		 250 aa  43.9  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1663  hypothetical protein  38.98 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25740  DNA replication protein  43.4 
 
 		 267 aa  40.8  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>