More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2740 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 392 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  83.51 
 
 		 389 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  61.82 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  59.9 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  50.93 
 
 		 381 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 386 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  44.82 
 
 		 375 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  44.8 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  41.98 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  46.36 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  41.91 
 
 		 377 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  41.71 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  41.71 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 367 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  43.8 
 
 		 380 aa  295  8e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  44.59 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 364 aa  290  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  41.53 
 
 		 364 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 		 376 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  44.39 
 
 		 367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  43.13 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  42.12 
 
 		 369 aa  278  9e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  40.85 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  40.35 
 
 		 342 aa  266  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  40.71 
 
 		 370 aa  264  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 		 375 aa  257  3e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  38.04 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  36.22 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  34.7 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 		 405 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.03 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  37.98 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  37.3 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 		 363 aa  219  7e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  34.93 
 
 		 561 aa  216  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  32.52 
 
 		 413 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  36.16 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  35.69 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.64 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  30.95 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  33.96 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  31.56 
 
 		 356 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 358 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  33.08 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 		 354 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  32.99 
 
 		 769 aa  182  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 496 aa  176  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  31.98 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  30.33 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 333 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  31.27 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 480 aa  152  8.999999999999999e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  32.52 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.88 
 
 		 390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.52 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.16 
 
 		 399 aa  143  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.68 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.31 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 378 aa  138  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.47 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 342 aa  136  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 404 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 379 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 399 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.49 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  28.96 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  28.06 
 
 		 399 aa  126  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>