More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2733 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  100 
 
 
506 aa  1021    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  28.21 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  33.48 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
269 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  35.54 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
207 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
272 aa  69.7  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
247 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 
233 aa  63.9  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  28.57 
 
 
658 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.67 
 
 
252 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 
262 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.11 
 
 
235 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  32.77 
 
 
233 aa  62  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0647  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.14 
 
 
278 aa  62  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00193935  hitchhiker  0.00940786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.76 
 
 
231 aa  61.6  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0402  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.88 
 
 
200 aa  60.8  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
215 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0381  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
200 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
238 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
270 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_345  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.88 
 
 
200 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.49 
 
 
241 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  31.86 
 
 
233 aa  59.3  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
409 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.33 
 
 
237 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 
269 aa  58.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3639  Methyltransferase type 11  28.32 
 
 
253 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.31 
 
 
249 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
328 aa  58.2  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.41 
 
 
235 aa  57.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.16 
 
 
231 aa  57.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  30.3 
 
 
351 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0506  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
251 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4199  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.78 
 
 
251 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.7 
 
 
258 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2020  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.54 
 
 
236 aa  57.4  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25 
 
 
420 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  31.84 
 
 
236 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.78 
 
 
237 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.83 
 
 
202 aa  57  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  33.04 
 
 
207 aa  57  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.84 
 
 
272 aa  57  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.91 
 
 
221 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3895  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.4649  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.67 
 
 
246 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0763  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.87 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159062  hitchhiker  0.0000667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0445  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187756  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4907  predicted protein  25.41 
 
 
227 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27365  normal  0.859905 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
251 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0777  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.87 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.974721 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0757  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.87 
 
 
230 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.89 
 
 
237 aa  56.6  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
201 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.67 
 
 
249 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  29.84 
 
 
258 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.91 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  41 
 
 
279 aa  55.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 
305 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
207 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
411 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  39.58 
 
 
243 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
330 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 
238 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0475  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  28.08 
 
 
251 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3132  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.7 
 
 
258 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
201 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.36 
 
 
260 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
259 aa  55.8  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  34.82 
 
 
281 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  25.87 
 
 
235 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  37.5 
 
 
257 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2339  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.63 
 
 
261 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260847 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
226 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 
218 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  28.69 
 
 
246 aa  55.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1619  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
244 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  30 
 
 
220 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4394  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
265 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2962  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
269 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.53 
 
 
241 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  36.46 
 
 
255 aa  54.7  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
270 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.46 
 
 
211 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  31.87 
 
 
252 aa  54.7  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32 
 
 
229 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.53 
 
 
241 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2785  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.48 
 
 
226 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.846293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>