46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2706 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2706  wyosine base formation  100 
 
 		 306 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0559  wyosine base formation domain-containing protein  68.46 
 
 		 264 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6990  wyosine base formation  65.78 
 
 		 267 aa  338  5e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6381  wyosine base formation  58.08 
 
 		 266 aa  297  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0318909  normal  0.0240218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4430  Wyosine base formation domain protein  49.43 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6364  Wyosine base formation domain protein  46.48 
 
 		 250 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16480  conserved hypothetical protein TIGR03084  46.85 
 
 		 271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5394  hypothetical protein  45.82 
 
 		 258 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5483  wyosine base formation  45.82 
 
 		 258 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308542  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5770  wyosine base formation  45.82 
 
 		 258 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0624769  normal  0.773498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3832  wyosine base formation  44.62 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.530439  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4873  Wyosine base formation domain protein  48.65 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6059  hypothetical protein  44.62 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1710  hypothetical protein  46.06 
 
 		 332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0848  wyosine base formation  45.24 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.57773  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4764  wyosine base formation domain-containing protein  46.42 
 
 		 268 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000208476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4556  hypothetical protein  45.6 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.67145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4324  wyosine base formation  45.86 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0254069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4597  wyosine base formation  42.53 
 
 		 270 aa  188  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.992249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0690  Wyosine base formation domain protein  46.53 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10035  hypothetical protein  41.6 
 
 		 257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.447139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3218  wyosine base formation  42.26 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0337846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3269  wyosine base formation  42.26 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3207  hypothetical protein  42.26 
 
 		 270 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6694  wyosine base formation  38.82 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.288227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2825  hypothetical protein  38.76 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.7298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2835  wyosine base formation  37.15 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3148  hypothetical protein  39.38 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0343  hypothetical protein  34 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1030  hypothetical protein  31.23 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.098599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1024  hypothetical protein  30.16 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4594  hypothetical protein  28.68 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2877  wyosine base formation  28.57 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2414  hypothetical protein  31.93 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.096621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05210  hypothetical protein  31.79 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13116  hypothetical protein  26.55 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0923  hypothetical protein  31.36 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0057  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2103  hypothetical protein  29.01 
 
 		 216 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1697  hypothetical protein  28.05 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.942057  normal  0.254485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3323  hypothetical protein  30.34 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115476  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3206  hypothetical protein  26.87 
 
 		 200 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000108092  hitchhiker  0.000809588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3875  hypothetical protein  28.77 
 
 		 196 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3963  hypothetical protein  28.77 
 
 		 196 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.73221  normal  0.396579 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3889  hypothetical protein  28.77 
 
 		 196 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0520  hypothetical protein  35.29 
 
 		 198 aa  42.7  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>