More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2644 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2644  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 391 aa  789    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000531608  normal  0.301355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2841  acetyl-CoA acetyltransferase  93.85 
 
 		 392 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.130609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  76.23 
 
 		 391 aa  587  1e-167  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5222  acetyl-CoA acetyltransferase  73.13 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.64162  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5018  acetyl-CoA acetyltransferase  75.45 
 
 		 392 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  75.45 
 
 		 392 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4724  acetyl-CoA acetyltransferase  75.45 
 
 		 392 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1536  acetyl-CoA acetyltransferase  71.76 
 
 		 398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2734  acetyl-CoA acetyltransferase  74.15 
 
 		 388 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13556  acetyl-CoA acetyltransferase  73.32 
 
 		 394 aa  564  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3966  propanoyl-CoA C-acyltransferase  70.73 
 
 		 392 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.238561  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1484  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  67.89 
 
 		 383 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3981  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  67.11 
 
 		 385 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.480226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3092  acetyl-CoA acetyltransferase  65.9 
 
 		 393 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2763  putative SCP-x_thiolase/acetyl- CoA acetyltransferase, PaaJ-like  37.28 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.470356  normal  0.471158 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0270  acetyl-CoA acetyltransferase  34.11 
 
 		 391 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00178908  normal  0.140204 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2782  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.63 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3786  acetyl-CoA acetyltransferase  32.65 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00704604  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  31.5 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2505  thiolase  34.64 
 
 		 387 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1290  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.72 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1626  acetyl-CoA acetyltransferase  32.28 
 
 		 387 aa  146  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  30.47 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0510  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.77 
 
 		 376 aa  143  6e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  31.84 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3319  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.68 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16037  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  31.79 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4153  thiolase family protein  33.07 
 
 		 387 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.526384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3483  Thiolase  32.04 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0675  Beta-ketoacyl synthase  28.15 
 
 		 395 aa  139  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0150  acetyl-CoA acetyltransferase  31.32 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1631  propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.26 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.34 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4151  thiolase  31.46 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17880  acetyl-CoA acetyltransferase  33.15 
 
 		 382 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.241643  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6295  thiolase  33.16 
 
 		 392 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0550  acetyl-CoA acetyltransferase  30.49 
 
 		 390 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4020  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.03 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.469452  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0596  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.77 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1933  acetyl-CoA acetyltransferase  29.84 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00196536  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0765  acetyl-CoA acetyltransferase  31.99 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.155191  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  30.69 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1926  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.5 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3907  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  32.06 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114937  normal  0.102476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3505  acetyl-CoA acetyltransferase  30.23 
 
 		 389 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2242  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.03 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0396  acetyl-CoA acetyltransferase  27.16 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  31.79 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1277  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.54 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2509  acetyl-CoA acetyltransferase  29.77 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.481347  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2362  acetyl-CoA acetyltransferase  31.32 
 
 		 386 aa  126  7e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1711  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  29.95 
 
 		 386 aa  125  9e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1512  lipid-transfer protein  32.22 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1541  lipid-transfer protein  32.22 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1564  lipid-transfer protein  32.22 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  30.08 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0646  acetyl-CoA acetyltransferase  29.97 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3523  3-ketoacyl-CoA thiolase  29.6 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2284  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.81 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0131646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0628  putative nonspecific lipid-transfer protein (sterol carrier protein)  31.46 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0489  acetyl-CoA acetyltransferase  30.59 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.201568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2025  lipid-transfer protein  29.55 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.957629  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  32.97 
 
 		 384 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  30.24 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  33.42 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1391  acetyl-CoA acetyltransferase  29.74 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4396  lipid-transfer protein  29.06 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2338  lipid-transfer protein  29.55 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12803  lipid-transfer protein  29.28 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00155026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4174  lipid-transfer protein  29.06 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.942812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4240  lipid-transfer protein  29.06 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.256435  normal  0.231931 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0689  acetyl-CoA acetyltransferase  29.44 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5768  lipid-transfer protein  29.16 
 
 		 397 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  26.46 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4757  lipid-transfer protein  29.04 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0932  lipid-transfer protein  26.75 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0386  acetyl-CoA acetyltransferase  28.39 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1838  thiolase  28.42 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  30.92 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2713  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  30.7 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00447624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1855  acetyl-CoA acetyltransferase  28.64 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0446253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4309  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  28 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1551  acetyl-CoA acetyltransferase  27.96 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2474  lipid-transfer protein  30.89 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4130  hypothetical protein  29.47 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.468644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3986  lipid-transfer protein  28.35 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4922  acetyl-CoA acetyltransferase  29.17 
 
 		 386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3077  acetyl-CoA acetyltransferase  29.63 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3870  thiolase  31.16 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.28834 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5826  lipid-transfer protein  29.55 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  31.3 
 
 		 386 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3588  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.11 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193067  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2602  thiolase  28.76 
 
 		 382 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.263214 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0178  lipid-transfer protein  30.41 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.925449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3673  thiolase  29.87 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.217678  normal  0.677274 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5033  thiolase  28.9 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3660  thiolase  29.87 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.277113  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5827  thiolase  28.9 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3733  thiolase  29.87 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.454317  normal  0.374229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>