More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2621 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  89.2 
 
 		 389 aa  668    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  100 
 
 		 395 aa  793    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  71.58 
 
 		 394 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  70.65 
 
 		 386 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  72.21 
 
 		 390 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  69.69 
 
 		 390 aa  541  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  70.28 
 
 		 390 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  67.65 
 
 		 391 aa  512  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  70.13 
 
 		 385 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  69.35 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  69.35 
 
 		 385 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  69.35 
 
 		 385 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  66.84 
 
 		 390 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  68.05 
 
 		 385 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  59.69 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  62.43 
 
 		 389 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  64.32 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  57.33 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  46.27 
 
 		 385 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  41.3 
 
 		 381 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  42.39 
 
 		 389 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  42.21 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  43.7 
 
 		 385 aa  249  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.5 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  40.1 
 
 		 388 aa  243  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  40.61 
 
 		 394 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.24 
 
 		 378 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1971  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  41.49 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  40.63 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  38.6 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  38.3 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.14 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  38.32 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  37.72 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1026  hypothetical protein  35.53 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.651118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0891  thiolase  33.5 
 
 		 405 aa  203  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.849216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  37.5 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  33.25 
 
 		 396 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  33.59 
 
 		 390 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  34.2 
 
 		 386 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  37.53 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  40.53 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2367  hypothetical protein  36.9 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  36.96 
 
 		 548 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  32.17 
 
 		 395 aa  186  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  34.28 
 
 		 385 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  36.76 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  36.5 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  36.5 
 
 		 550 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  37.79 
 
 		 548 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  35.71 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  33.68 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  33.96 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  34.03 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  34.9 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  32.51 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  33.17 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  34.36 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  36.49 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.57 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  33.93 
 
 		 389 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.29 
 
 		 388 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  34.13 
 
 		 380 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.29 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.29 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  32.06 
 
 		 541 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  32.82 
 
 		 394 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  31.82 
 
 		 400 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  33.83 
 
 		 453 aa  166  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  34.36 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  37.3 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4413  acetyl-CoA acetyltransferase  35.14 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00900083  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.91 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.97 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  34.83 
 
 		 389 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  33.86 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2935  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.9 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.220087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.7 
 
 		 402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.98 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  33.5 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  31.72 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  32.26 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3829  acetyl-CoA acetyltransferase  33.51 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.401188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.55 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  32.3 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  31.78 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  32.8 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  33.42 
 
 		 381 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  31.69 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  31.45 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.25 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  34.62 
 
 		 380 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  31.91 
 
 		 391 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4607  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.28 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.864443  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>