More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2514 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  100 
 
 
805 aa  1541    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  28.87 
 
 
1160 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  30.62 
 
 
1198 aa  144  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  29.1 
 
 
1055 aa  144  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 
1048 aa  140  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.76 
 
 
1046 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  25.63 
 
 
1093 aa  139  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.31 
 
 
1094 aa  138  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  28.63 
 
 
1142 aa  137  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.01 
 
 
1089 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.02 
 
 
1065 aa  128  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.02 
 
 
1081 aa  124  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.45 
 
 
1141 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.41 
 
 
1105 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.42 
 
 
1148 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 
1043 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  29.36 
 
 
1122 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  25.94 
 
 
1080 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.57 
 
 
1175 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  26.03 
 
 
1138 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 
1151 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.94 
 
 
1151 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
611 aa  111  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
1037 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.56 
 
 
1149 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
1096 aa  108  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  26.22 
 
 
1139 aa  105  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.66 
 
 
1014 aa  105  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.9 
 
 
1190 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.12 
 
 
1053 aa  100  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  27.8 
 
 
1204 aa  100  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.52 
 
 
1291 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  26.86 
 
 
1134 aa  99  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.54 
 
 
1285 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.13 
 
 
919 aa  96.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
524 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.32 
 
 
1055 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  35.63 
 
 
1027 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  34.17 
 
 
518 aa  95.5  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.17 
 
 
1087 aa  95.1  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
859 aa  94.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  32.07 
 
 
665 aa  94.7  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.49 
 
 
441 aa  94.4  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.89 
 
 
662 aa  93.6  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.46 
 
 
431 aa  94  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  30.6 
 
 
1358 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.16 
 
 
1050 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 
532 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 
1027 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  30.16 
 
 
1050 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  35.22 
 
 
1027 aa  93.2  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  29.13 
 
 
833 aa  92.8  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  19.61 
 
 
1153 aa  92.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  30.51 
 
 
526 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.42 
 
 
1226 aa  89.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  27.72 
 
 
479 aa  90.1  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  33.88 
 
 
701 aa  90.1  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
1429 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 
526 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.11 
 
 
737 aa  86.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.81 
 
 
1403 aa  86.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  23.63 
 
 
1271 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.96 
 
 
701 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  34.78 
 
 
675 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
735 aa  85.1  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  27.89 
 
 
858 aa  85.5  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.03 
 
 
1377 aa  84.7  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  30.9 
 
 
529 aa  84.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
738 aa  84.3  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  26.88 
 
 
860 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  28.09 
 
 
662 aa  84  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  32.07 
 
 
670 aa  83.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
1023 aa  84  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.31 
 
 
1117 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  32.46 
 
 
199 aa  83.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.56 
 
 
672 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
864 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  29.94 
 
 
487 aa  83.2  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.94 
 
 
1190 aa  83.2  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.56 
 
 
648 aa  82.4  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
1063 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.87 
 
 
681 aa  82  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.99 
 
 
1422 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  29.83 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  28.37 
 
 
515 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0991  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.24 
 
 
703 aa  80.9  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.358146  normal  0.0115754 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  28.64 
 
 
979 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.34 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.88 
 
 
757 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 
746 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.89 
 
 
701 aa  79  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
593 aa  79  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  32.74 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  31.77 
 
 
1180 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  25.12 
 
 
1227 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  26.88 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  28.93 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 
758 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>