83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2511 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  81.78 
 
 		 483 aa  722    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  100 
 
 		 477 aa  950    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.36 
 
 		 481 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  34.65 
 
 		 509 aa  177  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  31.31 
 
 		 461 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  33.5 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  32.56 
 
 		 466 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  30.84 
 
 		 532 aa  156  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  32 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  32.14 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  31.45 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  32.33 
 
 		 462 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  34.91 
 
 		 501 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.56 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  33.49 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  32.09 
 
 		 476 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  31.25 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.17 
 
 		 464 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  31.78 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.7 
 
 		 479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  33.17 
 
 		 454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  33.58 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  28.76 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.81 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  31.98 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  31.07 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  30.23 
 
 		 477 aa  136  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  31.49 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  31.83 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  29.85 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  30.39 
 
 		 454 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  32.16 
 
 		 452 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  32.03 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  30.06 
 
 		 441 aa  127  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  32.14 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  30.88 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  31.66 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  31.85 
 
 		 435 aa  124  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  31.4 
 
 		 455 aa  123  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  31.44 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  30.75 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  30.14 
 
 		 461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  31.47 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  30.6 
 
 		 477 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  33.89 
 
 		 446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  32.7 
 
 		 457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  30.08 
 
 		 464 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  31.34 
 
 		 557 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  33.33 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  32.01 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  29.68 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  31.21 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  27.65 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.75 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  29.41 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  29.64 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  32.65 
 
 		 673 aa  87.8  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  34.35 
 
 		 840 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  30 
 
 		 1318 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.65 
 
 		 767 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  26.67 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  27.06 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.73 
 
 		 541 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  27.58 
 
 		 759 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  41.04 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  22.83 
 
 		 527 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  30.57 
 
 		 852 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32 
 
 		 1037 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  33.56 
 
 		 2192 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  27.73 
 
 		 593 aa  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  37.17 
 
 		 717 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  32 
 
 		 558 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.51 
 
 		 863 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  26.53 
 
 		 1296 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  31.9 
 
 		 1092 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  31.89 
 
 		 1619 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  28.91 
 
 		 350 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  39.51 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.64 
 
 		 601 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.03 
 
 		 1332 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  28.18 
 
 		 2160 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1010 aa  43.5  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  26.96 
 
 		 523 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>