More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2480 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  90.3 
 
 		 408 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  100 
 
 		 408 aa  807    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  41.1 
 
 		 409 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  42.86 
 
 		 423 aa  259  9e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  39.55 
 
 		 402 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  41.55 
 
 		 421 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  38.92 
 
 		 404 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  37.53 
 
 		 401 aa  236  4e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  37.78 
 
 		 417 aa  235  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  37.16 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  37.07 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  37.07 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  36.83 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.23 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  34.38 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  38.11 
 
 		 398 aa  229  7e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  36.43 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  37.62 
 
 		 429 aa  225  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.05 
 
 		 405 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  36.36 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  36.88 
 
 		 407 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  38.44 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.57 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  35.01 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.08 
 
 		 407 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  33.5 
 
 		 399 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  35.99 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1726  cytochrome P450  35.31 
 
 		 387 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.319126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.24 
 
 		 426 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  38.34 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.16 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  36.87 
 
 		 410 aa  206  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  35.45 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.77 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  34.52 
 
 		 410 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1816  cytochrome P450  33.76 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.393276  normal  0.302822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  35.2 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  39.38 
 
 		 414 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  39.71 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  39.71 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  39.71 
 
 		 406 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  39.2 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  35.06 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  41.39 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  36.02 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  31.5 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  35.68 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  34.61 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  36.18 
 
 		 408 aa  200  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  34.25 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3157  putative cytochrome P450  37.07 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.192743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  32.84 
 
 		 411 aa  199  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.35 
 
 		 409 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  35.18 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  36.26 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  35.35 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  38.94 
 
 		 357 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  38.67 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  33.84 
 
 		 408 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  32.02 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  37.37 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  34.35 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11908  cytochrome P450 140 cyp140  35.4 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.818643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  36.91 
 
 		 423 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  40.6 
 
 		 399 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  32.47 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  32.01 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  37.85 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4313  cytochrome P450  35.26 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1075  cytochrome P450  40.18 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  36.29 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  32.01 
 
 		 411 aa  193  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1245  cytochrome P450  32.42 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  34.8 
 
 		 429 aa  192  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  40 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  34.39 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  35.37 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  33.09 
 
 		 412 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  34.58 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  33.42 
 
 		 405 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  34.43 
 
 		 422 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  33.25 
 
 		 413 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0342  cytochrome P450  36.19 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  35.75 
 
 		 430 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0173  cytochrome P450  37 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  33.5 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  32.68 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  37.94 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  35.28 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8861  hypothetical protein  35.9 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  32.19 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  36.22 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  36.22 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1961  cytochrome P450  37.65 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  35 
 
 		 393 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  36.22 
 
 		 447 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0674  cytochrome P450  37.18 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.544663  normal  0.200583 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  32.78 
 
 		 417 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0598  cytochrome P450  38.39 
 
 		 419 aa  186  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1599  cytochrome P450  36.61 
 
 		 399 aa  186  8e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.658435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>