85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2386 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2386  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2524  hypothetical protein  79.18 
 
 
316 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  41.95 
 
 
273 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  35.21 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  41.3 
 
 
301 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  39.36 
 
 
288 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2730  protein of unknown function DUF881  44.86 
 
 
306 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.242021  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  33.94 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  37.41 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  34.69 
 
 
286 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  37.45 
 
 
290 aa  105  7e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  34.95 
 
 
276 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  38.49 
 
 
290 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  29.06 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  34.02 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5001  hypothetical protein  36.73 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  31.02 
 
 
296 aa  94  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  32.6 
 
 
239 aa  93.2  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  34.26 
 
 
249 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  32.04 
 
 
297 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  33.96 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1464  hypothetical protein  33.06 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.420029  normal  0.0366488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  31.9 
 
 
250 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  34.62 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  31.44 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  33.69 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  33.69 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  35.81 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  33.69 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0033  protein of unknown function DUF881  35.08 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.249833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  36.06 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  37.69 
 
 
234 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  27.62 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.35 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  27.87 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  31.91 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27030  hypothetical protein  29.58 
 
 
252 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  36.84 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  26.21 
 
 
245 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  33.88 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  31.22 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  27.08 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0801  hypothetical protein  29.13 
 
 
349 aa  73.2  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0028  hypothetical protein  24.42 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  28.5 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  28.38 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  31.08 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  30.96 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4438  hypothetical protein  33.73 
 
 
329 aa  68.9  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.226653  normal  0.348599 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  32.09 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  29.82 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  30.05 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00170  hypothetical protein  28.94 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0524836  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  30.21 
 
 
235 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  29.81 
 
 
243 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  32.82 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  27.98 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  30.08 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  34.94 
 
 
309 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  24.68 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  30.89 
 
 
234 aa  62.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0057  hypothetical protein  32.53 
 
 
267 aa  62.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.573043 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  30.34 
 
 
238 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0132  hypothetical protein  33.57 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0808473  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  30.2 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  27.69 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  30.77 
 
 
230 aa  60.1  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  31.85 
 
 
233 aa  59.3  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  24.68 
 
 
243 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  28.81 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  31.13 
 
 
249 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  28.48 
 
 
243 aa  55.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  24.03 
 
 
236 aa  55.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  22.77 
 
 
236 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  27.61 
 
 
331 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  28.4 
 
 
309 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1895  protein of unknown function DUF881  34.75 
 
 
238 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  30.58 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  23.5 
 
 
238 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  28.37 
 
 
271 aa  42.7  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  22.84 
 
 
238 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  29 
 
 
383 aa  43.1  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>