64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2384 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  80.38 
 
 		 309 aa  447  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  47.11 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  41.13 
 
 		 436 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  42.73 
 
 		 383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  45.07 
 
 		 255 aa  143  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  42.24 
 
 		 388 aa  136  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  37.76 
 
 		 271 aa  136  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  36.4 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  35.92 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  35.92 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  35.92 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  41.15 
 
 		 283 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  42.29 
 
 		 258 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  37.04 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  36.28 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  38.02 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  36.45 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  40.54 
 
 		 248 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  38.54 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  31.68 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  30.8 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  38.55 
 
 		 571 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  35.35 
 
 		 245 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  32.92 
 
 		 296 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  30.25 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  32.91 
 
 		 234 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  33.14 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  28.07 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  25.31 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  25.99 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  25.1 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  25.87 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  29.59 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  23.76 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  28.05 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  29.02 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.98 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  26.04 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  23.32 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  30.13 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  27.55 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  24.74 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  28.57 
 
 		 239 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  26.6 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  28.35 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  26.34 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  25 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  27.01 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1285  protein of unknown function DUF881  27.46 
 
 		 246 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  25.42 
 
 		 280 aa  47.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  29.41 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  29.61 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  28.71 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  27.86 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  25.81 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  20.1 
 
 		 238 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  28.16 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  32.41 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  33.09 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  28.51 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>