89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2358 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  75.82 
 
 
483 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  942    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  72.52 
 
 
509 aa  622  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  73.43 
 
 
476 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  47.44 
 
 
481 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  47.08 
 
 
501 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.37 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  36.64 
 
 
461 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  40.05 
 
 
459 aa  210  5e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.77 
 
 
464 aa  210  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  35.9 
 
 
464 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  37.97 
 
 
468 aa  203  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  38.61 
 
 
462 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  37.61 
 
 
459 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  40.51 
 
 
461 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.46 
 
 
465 aa  199  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  39.75 
 
 
465 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  39.75 
 
 
439 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  38.12 
 
 
460 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  40.55 
 
 
450 aa  190  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  38.59 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  36.07 
 
 
454 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  37.53 
 
 
464 aa  180  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  37.39 
 
 
435 aa  179  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  38.21 
 
 
446 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  36.87 
 
 
467 aa  173  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  39.43 
 
 
361 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.33 
 
 
462 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  38.73 
 
 
452 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.51 
 
 
478 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  39.12 
 
 
454 aa  169  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  37.15 
 
 
457 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  37.75 
 
 
454 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  36.14 
 
 
455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  37.58 
 
 
557 aa  166  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  39.31 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  39.09 
 
 
415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  37.33 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  38.41 
 
 
457 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  38.38 
 
 
505 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  37.67 
 
 
466 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  37.13 
 
 
435 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  32.46 
 
 
532 aa  160  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.58 
 
 
477 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  40.38 
 
 
433 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  36.96 
 
 
473 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  37.74 
 
 
493 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.09 
 
 
483 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  34.72 
 
 
462 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.46 
 
 
523 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  37.26 
 
 
477 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  40.25 
 
 
432 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  35.2 
 
 
464 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  37.37 
 
 
496 aa  146  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  37.12 
 
 
476 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  36.73 
 
 
448 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  37.5 
 
 
673 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  35 
 
 
759 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  35.94 
 
 
840 aa  87.4  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.64 
 
 
1296 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  32.41 
 
 
863 aa  70.5  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  28.24 
 
 
530 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  25.8 
 
 
541 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  33.71 
 
 
350 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  26.03 
 
 
767 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  28.97 
 
 
575 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  31.47 
 
 
1755 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  39.34 
 
 
362 aa  57  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.28 
 
 
852 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  26.33 
 
 
591 aa  53.9  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  30.63 
 
 
2160 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  27.72 
 
 
1037 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  33.33 
 
 
523 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  26.56 
 
 
1359 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  28.29 
 
 
527 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  27.86 
 
 
1010 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  34.02 
 
 
1092 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  28.57 
 
 
1023 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.48 
 
 
884 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  28.08 
 
 
743 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  29.65 
 
 
558 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  31.01 
 
 
2192 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  26.24 
 
 
575 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  29.13 
 
 
545 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  29.26 
 
 
1332 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  35.58 
 
 
168 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02579  hypothetical protein  23.87 
 
 
516 aa  43.5  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  36.04 
 
 
572 aa  43.5  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  26.76 
 
 
1061 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>