More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2357 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  100 
 
 		 167 aa  330  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  90.85 
 
 		 168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  56.44 
 
 		 180 aa  197  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  55.56 
 
 		 181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  57.93 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  53.99 
 
 		 188 aa  190  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  59.75 
 
 		 161 aa  187  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  56.79 
 
 		 181 aa  183  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  54.6 
 
 		 181 aa  181  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  55.49 
 
 		 182 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  53.37 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  53.05 
 
 		 182 aa  177  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  53.99 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  53.37 
 
 		 186 aa  175  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  52.76 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  53.37 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  55.83 
 
 		 204 aa  170  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  52.2 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  54.6 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  53.09 
 
 		 181 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  53.46 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  49.38 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  50.3 
 
 		 183 aa  157  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  50 
 
 		 162 aa  157  7e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  48.1 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  55.21 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  49.38 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  50.31 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  48.12 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  52.2 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  48.1 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  48.45 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  53.55 
 
 		 159 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  47.13 
 
 		 190 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  46.24 
 
 		 183 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  46.82 
 
 		 195 aa  147  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  49.4 
 
 		 230 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  50.6 
 
 		 213 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  48.59 
 
 		 197 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  49.72 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  42.65 
 
 		 230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  48.02 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  53.38 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  48.15 
 
 		 182 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  47.22 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  47.22 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  47.22 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  54.79 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  45.18 
 
 		 192 aa  130  6e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  49.09 
 
 		 185 aa  130  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  47.73 
 
 		 200 aa  128  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  48.3 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  43.41 
 
 		 198 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  41.25 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  41.25 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  44.71 
 
 		 215 aa  124  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  44.23 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  47.8 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1964  peptide deformylase  43.2 
 
 		 219 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.0000000418525  hitchhiker  0.000000552794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.01 
 
 		 190 aa  120  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  41.38 
 
 		 221 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4287  peptide deformylase  41.32 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  45.78 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.61 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  44.17 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  40.48 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  41.21 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  37.72 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  38.51 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  40.61 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  41.45 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  40.61 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2867  peptide deformylase  42.68 
 
 		 170 aa  117  7e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  40 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  41.5 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  41.06 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.45 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.91 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  42.67 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  41.14 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  38.18 
 
 		 168 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2843  polypeptide deformylase  37.5 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0014  peptide deformylase  40 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  39.13 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  39.16 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0762  peptide deformylase  39.39 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.458132  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  38.32 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  37.04 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  44.57 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0762  peptide deformylase  38.46 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100795  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  44.17 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0019  peptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0725  peptide deformylase  38.79 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00170  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  37.04 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  37.24 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  38.27 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0177  polypeptide deformylase  38.71 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0768  peptide deformylase  38.41 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0336972  normal  0.920717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>