281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2333 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2333  major intrinsic protein  100 
 
 		 215 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000971735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2455  major intrinsic protein  94.88 
 
 		 215 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1589  major intrinsic protein  55.5 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026297 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0165  MIP family channel protein  34.58 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0297  MIP family channel protein  34.58 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12070  permease, glycerol uptake facilitator  31.76 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0968593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0011  MIP family channel protein  34.07 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2637  major intrinsic protein  38.57 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1895  MIP family channel protein  34.72 
 
 		 238 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144507  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0047  glycerol uptake facilitator related permease  33.04 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0561  major intrinsic protein  33.03 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2042  glycerol uptake facilitator, MIP channel  31.17 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.439233  normal  0.219403 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3163  MIP family channel protein  36 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793787  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0154  MIP family channel protein  35.02 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0333  major intrinsic protein  35.02 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.881895  normal  0.131198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3605  aquaporin Z  31.78 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0702  MIP family channel protein  31.06 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1284  hypothetical protein  35.63 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0466  MIP family channel protein  31.14 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00747892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4402  aquaporin Z  31.94 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4742  aquaporin Z  31.94 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0809  MIP family channel protein  33.8 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000461321 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2320  MIP family channel protein  33.48 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4633  aquaporin Z  31.94 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4254  aquaporin Z  31.48 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0111  aquaporin Z  30.71 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4619  aquaporin Z  31.48 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1100  major intrinsic protein  36.16 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.591706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4242  aquaporin Z  31.94 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.014087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0620  aquaporin Z  31.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4635  aquaporin Z  31.48 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3745  aquaporin Z  32.42 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.914772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4335  major intrinsic protein  31.48 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0239  MIP family channel protein  35.23 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.507292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4615  aquaporin Z  31.48 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3671  aquaporin Z  31.51 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07120  aquaporin Z  30 
 
 		 237 aa  71.6  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152443  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1636  Na+/H+ antiporter NhaC  31.31 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.314424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0235  MIP family channel protein  29.05 
 
 		 241 aa  71.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1692  MIP family channel protein  32.78 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1071  aquaporin Z  30.87 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1009  aquaporin Z  29.74 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.999932 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1676  aquaporin Z  28.26 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2982  aquaporin Z  29.8 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.727537  decreased coverage  0.0000000621179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1139  MIP family channel protein  34.08 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2034  MIP family channel protein  29.06 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3576  MIP family channel protein  35.59 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.617496  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3823  aquaporin Z  28.76 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0147  MIP family channel protein  32.58 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0427872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11660  aquaporin Z  30.87 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1040  MIP family channel protein  35.27 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0786  MIP family channel protein  34.18 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.307051  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0208  MIP family channel protein  32.58 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.926857  normal  0.247328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0357  major intrinsic protein  32.29 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0988  aquaporin Z  28.09 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.505214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3229  MIP family channel protein  29.49 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4099  aquaporin Z  28.21 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1241  MIP family channel protein  29.49 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000683492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0790  major intrinsic protein  31.43 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3036  MIP family channel protein  29.49 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0489  major intrinsic protein  33.73 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  26.19 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1174  MIP family channel protein  29.2 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2859  aquaporin Z  29.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0248  aquaporin Z  29.78 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0941  MIP family channel protein  35.81 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0230  aquaporin Z  29.78 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0851  MIP family channel protein  33.33 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0981  aquaporin Z  29.86 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0400  MIP family channel protein  30.88 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1167  aquaporin Z  29.55 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.56662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1211  aquaporin Z  29.55 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  29.66 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4282  aquaporin Z  28.95 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0544135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  28.46 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2782  aquaporin z, major Intrinsic protein (MIP) family  32.69 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3350  aquaporin Z  29.78 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.396985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1206  aquaporin Z  29.55 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161094  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3846  aquaporin Z  27.19 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452606 
 
 
-
 
NC_004310  BR2001  aquaporin Z  29.86 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0179  aquaporin Z  28.95 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000341158 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3945  aquaporin Z  28.12 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.650351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1307  aquaporin Z  29.68 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0324  MIP family channel protein  29.63 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2364  MIP family channel protein  26.78 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3356  major intrinsic protein  30.05 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.47386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0157  aquaporin Z  29.09 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.704052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0369  MIP family channel protein  30.41 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1424  MIP family channel protein  32.21 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256301  normal  0.0658182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1586  aquaporin Z  28.51 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1724  aquaporin Z  27.71 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000103912 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02220  MIP family channel protein  30.74 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.967608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1244  aquaporin Z  29.09 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.9193  normal  0.344716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1151  MIP family channel protein  28.88 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2101  major intrinsic protein  32.21 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.71404  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4980  MIP family channel protein  29.96 
 
 		 238 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0631888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3064  aquaporin Z  29.68 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.158799  decreased coverage  0.0000000187933 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2868  aquaporin Z  28.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3107  aquaporin Z  28.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.536617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0085  aquaporin Z  28.12 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>