More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2233 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  91.05 
 
 		 849 aa  1407    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  100 
 
 		 849 aa  1625    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  44.18 
 
 		 854 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  40.3 
 
 		 842 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  39.51 
 
 		 843 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  41.54 
 
 		 834 aa  489  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  40.69 
 
 		 848 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  39.1 
 
 		 845 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  35.15 
 
 		 847 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.34 
 
 		 852 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  34.79 
 
 		 853 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 856 aa  363  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  36.11 
 
 		 836 aa  345  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  37.12 
 
 		 806 aa  340  7e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 		 859 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  36.52 
 
 		 857 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  32.23 
 
 		 855 aa  314  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  34.39 
 
 		 861 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  34.89 
 
 		 853 aa  300  7e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  34.42 
 
 		 838 aa  288  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  35.27 
 
 		 853 aa  282  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.11 
 
 		 930 aa  277  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  34.55 
 
 		 825 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  33.66 
 
 		 873 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  31.82 
 
 		 841 aa  263  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  32.29 
 
 		 861 aa  256  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.3 
 
 		 855 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.24 
 
 		 866 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  32.13 
 
 		 839 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.01 
 
 		 821 aa  213  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.71 
 
 		 828 aa  212  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  31.85 
 
 		 846 aa  197  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  30.38 
 
 		 873 aa  185  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  26.15 
 
 		 880 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.45 
 
 		 859 aa  170  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  28.23 
 
 		 871 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  23.83 
 
 		 897 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  26.86 
 
 		 850 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.74 
 
 		 870 aa  131  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.12 
 
 		 851 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  29.65 
 
 		 878 aa  128  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  31.74 
 
 		 846 aa  127  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 857 aa  126  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.6 
 
 		 866 aa  125  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 849 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 855 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.49 
 
 		 858 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.09 
 
 		 854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.08 
 
 		 835 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.76 
 
 		 849 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.35 
 
 		 863 aa  116  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 849 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 		 839 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  25.09 
 
 		 850 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  19.73 
 
 		 857 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 822 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.04 
 
 		 801 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  26.25 
 
 		 841 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  19.75 
 
 		 856 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.14 
 
 		 807 aa  97.4  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.17 
 
 		 855 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  26.05 
 
 		 852 aa  95.9  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 847 aa  91.7  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 847 aa  90.9  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.14 
 
 		 402 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.69 
 
 		 404 aa  89  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 		 452 aa  88.2  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  31.21 
 
 		 413 aa  88.6  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 		 837 aa  88.2  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  25.61 
 
 		 838 aa  85.5  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.11 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.39 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  35.32 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 		 775 aa  83.2  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.44 
 
 		 371 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 822 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  24.32 
 
 		 846 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 838 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  46.61 
 
 		 855 aa  78.6  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.58 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  26.38 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  24.16 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.92 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  28.28 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  27.2 
 
 		 843 aa  75.1  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  28.3 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0585  hypothetical protein  26.14 
 
 		 402 aa  73.9  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000219996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  30.82 
 
 		 826 aa  72.4  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  22.21 
 
 		 831 aa  72.4  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 		 828 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  29.48 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.24 
 
 		 649 aa  72  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.99 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  31.36 
 
 		 715 aa  72  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  28.48 
 
 		 896 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  30.89 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0349  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 400 aa  70.5  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  29.41 
 
 		 858 aa  70.5  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  24.21 
 
 		 649 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>