More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2198 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 		 479 aa  937    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  53.44 
 
 		 630 aa  348  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  47.28 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  42.17 
 
 		 489 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  41.18 
 
 		 486 aa  307  3e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  41.28 
 
 		 503 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  42.42 
 
 		 490 aa  288  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  40.56 
 
 		 503 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  40.94 
 
 		 492 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  40.38 
 
 		 494 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  37.87 
 
 		 477 aa  234  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  38.55 
 
 		 497 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  37.97 
 
 		 475 aa  231  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  39.75 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  35.94 
 
 		 497 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  38.51 
 
 		 475 aa  219  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  37.87 
 
 		 488 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  35.73 
 
 		 479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  35.12 
 
 		 497 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  36.06 
 
 		 496 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  36.31 
 
 		 499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  36.92 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  35.82 
 
 		 474 aa  207  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  35.48 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  35.1 
 
 		 515 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  35.04 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  36.06 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  36.06 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  36.06 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  35.62 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  37.32 
 
 		 496 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  36.08 
 
 		 488 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  30.42 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  28.94 
 
 		 483 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  35.68 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  36.85 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  36.21 
 
 		 486 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  35.45 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  35.45 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  35.71 
 
 		 478 aa  173  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  35.14 
 
 		 567 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  34.26 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  33.67 
 
 		 578 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  35.24 
 
 		 485 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  35.47 
 
 		 522 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  32.8 
 
 		 503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  34.5 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  33.97 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  33.68 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  32.45 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  31.97 
 
 		 544 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  34.97 
 
 		 535 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  33.61 
 
 		 480 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  36.52 
 
 		 548 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  36.52 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  36.52 
 
 		 548 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  32.46 
 
 		 546 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  32.06 
 
 		 549 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  34.92 
 
 		 505 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.28 
 
 		 540 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  33.08 
 
 		 509 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  33.85 
 
 		 506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  32.77 
 
 		 519 aa  148  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  31.26 
 
 		 515 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  32.81 
 
 		 518 aa  146  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  31.51 
 
 		 574 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  31.84 
 
 		 550 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  31.47 
 
 		 574 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  33.71 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  33.7 
 
 		 548 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  32.98 
 
 		 552 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  31.19 
 
 		 505 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  32.8 
 
 		 508 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.47 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.47 
 
 		 548 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  34.62 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2883  pentachlorophenol monooxygenase  31.46 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2852  pentachlorophenol monooxygenase  31.71 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.43223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2896  pentachlorophenol monooxygenase  31.71 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.522184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4215  hypothetical protein  35.57 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0566809  hitchhiker  0.000593788 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  32.27 
 
 		 611 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  35.6 
 
 		 515 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  33.14 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  32.39 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  32.39 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  33.24 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  34.3 
 
 		 388 aa  131  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  33.24 
 
 		 498 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  32.01 
 
 		 547 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  31.58 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0291  FAD-dependent oxidoreductase  32.6 
 
 		 545 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339644  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  33.89 
 
 		 506 aa  126  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3793  monooxygenase, FAD-binding  33.05 
 
 		 524 aa  126  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.791839  normal  0.0125936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0725  monooxygenase FAD-binding  31.05 
 
 		 571 aa  126  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.490959  normal  0.227588 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  29.48 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  30.02 
 
 		 502 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0143  monooxygenase FAD-binding protein  31.22 
 
 		 968 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>