More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2184 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  44.3 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  43.22 
 
 		 247 aa  158  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  42.49 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  42.98 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  42.62 
 
 		 252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  41.56 
 
 		 256 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  41.3 
 
 		 272 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  42.41 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  38.84 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  39.75 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  41.44 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  41.44 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  40.72 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  39.73 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  45.54 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  41.21 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  38.53 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  41.2 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  33.61 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  37.67 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.09 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  43.58 
 
 		 236 aa  118  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  41.36 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  38.06 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1129  peptidase C26  38.81 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0971  peptidase C26  39.37 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.174488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.71 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  38.25 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0944  peptidase C26  37.96 
 
 		 253 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  36.92 
 
 		 255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.65 
 
 		 273 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  38.27 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.55 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  37.5 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  34.55 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  35.34 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3012  peptidase C26  33.33 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  30.16 
 
 		 238 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  34.51 
 
 		 244 aa  112  9e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.07 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  28.57 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  39.18 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  35.65 
 
 		 493 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.07 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  40.7 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2318  peptidase C26  35.07 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  35.65 
 
 		 251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  38.22 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  38.67 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  37.12 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.87 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  34.27 
 
 		 479 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  33.61 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  38.1 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  38.1 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  38.1 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  38.1 
 
 		 253 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  38.07 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  36.96 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1059  peptidase C26  34.15 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  35.83 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  35.87 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  40.3 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  37.78 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  28.51 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  32.45 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  31.36 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.41 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  37.78 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  36.28 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  37.78 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2645  glutamine amidotransferase  32.65 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  42.4 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  33.64 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  37.84 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  41.67 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  28.4 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  34.56 
 
 		 231 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  31.82 
 
 		 242 aa  105  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  34.22 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.29 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  35.14 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  33.33 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  36.89 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  33.33 
 
 		 444 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  33.33 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  41.2 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  33.33 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1111  peptidase C26  36.67 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.517876 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  35.21 
 
 		 230 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  33.33 
 
 		 442 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  37.17 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2356  glutamine amidotransferase, class I  38.25 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  38.5 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2813  peptidase C26  34.55 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  34.55 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>