More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2175 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  100 
 
 
316 aa  634    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.41 
 
 
317 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  64.98 
 
 
320 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  58.43 
 
 
361 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  63.58 
 
 
306 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  61.62 
 
 
335 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
319 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  62.63 
 
 
306 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  58.46 
 
 
346 aa  358  6e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  61.87 
 
 
301 aa  358  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.56 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
313 aa  352  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  60.94 
 
 
324 aa  352  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  59.55 
 
 
355 aa  350  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  59.55 
 
 
314 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  56.51 
 
 
315 aa  348  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  57.96 
 
 
318 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  57.1 
 
 
313 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  59.87 
 
 
348 aa  345  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  57.63 
 
 
368 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  60.61 
 
 
328 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  57.91 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  58.94 
 
 
314 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  58.47 
 
 
310 aa  342  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  59.03 
 
 
373 aa  340  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  56.57 
 
 
319 aa  338  5e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  57.57 
 
 
313 aa  338  9e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  60.27 
 
 
310 aa  336  2.9999999999999997e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  59.6 
 
 
314 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  56.96 
 
 
312 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  56.68 
 
 
310 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  57.65 
 
 
309 aa  333  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  56.23 
 
 
309 aa  332  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  59.26 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  59.26 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  59.26 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  58 
 
 
301 aa  328  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  54.88 
 
 
314 aa  328  8e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  56.11 
 
 
304 aa  326  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  55.66 
 
 
322 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  59.45 
 
 
308 aa  321  8e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  57.05 
 
 
303 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  57.86 
 
 
302 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  54.61 
 
 
305 aa  311  5.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  56.9 
 
 
303 aa  309  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  54.15 
 
 
318 aa  309  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.03 
 
 
305 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  53.31 
 
 
302 aa  305  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  53.04 
 
 
330 aa  305  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  56.58 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  54.05 
 
 
337 aa  301  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  57 
 
 
305 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.52 
 
 
252 aa  298  8e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  51.26 
 
 
327 aa  296  4e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.29 
 
 
304 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  52.22 
 
 
316 aa  288  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  62.62 
 
 
241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  52.23 
 
 
311 aa  278  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  44.63 
 
 
330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.72 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  50.86 
 
 
311 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  45.13 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  49.84 
 
 
330 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  50.52 
 
 
300 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.17 
 
 
324 aa  265  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  46.96 
 
 
457 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  61.84 
 
 
234 aa  255  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.44 
 
 
319 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
298 aa  250  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  46.53 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
308 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  58.41 
 
 
244 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  47.78 
 
 
297 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  46.62 
 
 
305 aa  238  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.67 
 
 
238 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  44.41 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46 
 
 
297 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  46.62 
 
 
314 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  46.92 
 
 
496 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  45.48 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  47.44 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  45.17 
 
 
302 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.71 
 
 
303 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.76 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  53.88 
 
 
245 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  55.88 
 
 
258 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.92 
 
 
247 aa  215  8e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  46.28 
 
 
317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  42.57 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.99 
 
 
350 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  52.51 
 
 
242 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
237 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  49.35 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
311 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.49 
 
 
264 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.330888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2408  ABC transporter related  51.16 
 
 
232 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.75 
 
 
301 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40.6 
 
 
300 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>