More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2163 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  100 
 
 		 350 aa  701    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  97.14 
 
 		 350 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  63.71 
 
 		 349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  65.9 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  67.15 
 
 		 351 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  56.3 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  56.16 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  45.66 
 
 		 348 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  45.64 
 
 		 344 aa  297  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  49.54 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  46.55 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  50.9 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  49.27 
 
 		 339 aa  286  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  50 
 
 		 352 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  43.35 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  49.4 
 
 		 372 aa  279  5e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  45.11 
 
 		 349 aa  279  6e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  47.16 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  45.72 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  45.72 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.72 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  44.7 
 
 		 351 aa  272  5.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  46.26 
 
 		 339 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  43.97 
 
 		 346 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  45.02 
 
 		 346 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  45.4 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  44.24 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  44.24 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  44.24 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  44.07 
 
 		 343 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 347 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  44.41 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  43.97 
 
 		 341 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  48.78 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  44.07 
 
 		 343 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  47.01 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  44.28 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  43.11 
 
 		 343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  42.42 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  44.98 
 
 		 355 aa  247  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  40.5 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  43.6 
 
 		 342 aa  239  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  39.94 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  44.79 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  38.55 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  38.55 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  43.39 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.09 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  36.31 
 
 		 333 aa  179  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  37.13 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.22 
 
 		 334 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  30.92 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.75 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  24.92 
 
 		 321 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  33.12 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  31.88 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  33.85 
 
 		 346 aa  124  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.04 
 
 		 357 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  31.89 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  32.68 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.83 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  30.72 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  32.18 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  30.72 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.18 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.39 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.39 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.39 
 
 		 340 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.98 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.75 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3219  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.82 
 
 		 299 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.58554  normal  0.82683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  28.72 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  28.72 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.8 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  30.72 
 
 		 360 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  28.37 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  30.52 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1121  luciferase family protein  28.34 
 
 		 341 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3959  luciferase family protein  28.01 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6536  hypothetical protein  31.27 
 
 		 352 aa  89.4  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  29.14 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 		 343 aa  87.8  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  27.38 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.35 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  28.9 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 		 333 aa  85.9  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4369  F420-dependent oxidoreductase  30.84 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.257639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  32.75 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1109  luciferase family protein  24.07 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  27.71 
 
 		 353 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  28.61 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  28.61 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.39 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  28.61 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2690  luciferase family protein  29.02 
 
 		 340 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  39.68 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>