More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2114 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  92.08 
 
 		 444 aa  788    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  894    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  72.85 
 
 		 437 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  70.47 
 
 		 442 aa  594  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  66.9 
 
 		 447 aa  569  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  67.52 
 
 		 468 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  64.92 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  61.34 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  60.92 
 
 		 446 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  63.11 
 
 		 442 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  63.14 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  58.43 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  55.46 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  54.29 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  54.29 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  51.03 
 
 		 437 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  54.29 
 
 		 436 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  54.9 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  54.61 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  54.38 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  53.85 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  46.44 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  40 
 
 		 766 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  38.72 
 
 		 412 aa  289  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  36.51 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  35.75 
 
 		 416 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.75 
 
 		 416 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  34.48 
 
 		 436 aa  263  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  39.63 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  32.51 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  33.99 
 
 		 428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  34.37 
 
 		 423 aa  189  7e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  33.64 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  34.52 
 
 		 414 aa  186  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2207  hypothetical protein  35.84 
 
 		 374 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  34.85 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  32.03 
 
 		 437 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1740  protein of unknown function DUF323  35.59 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  32.73 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  36.94 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2927  hypothetical protein  33.03 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19140  hypothetical protein  31.46 
 
 		 425 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.500437  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  39.66 
 
 		 819 aa  171  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3087  hypothetical protein  33.26 
 
 		 423 aa  170  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  33.1 
 
 		 428 aa  169  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3265  hypothetical protein  33.18 
 
 		 437 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.618561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2450  protein of unknown function DUF323  34.87 
 
 		 433 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00600286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  35.11 
 
 		 447 aa  169  9e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1924  hypothetical protein  32.83 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2423  hypothetical protein  35.2 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0647935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1640  hypothetical protein  32.71 
 
 		 433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  35.93 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  33.18 
 
 		 429 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  36.16 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  34.7 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  33.26 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03588  hypothetical protein  32.88 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.802275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  31.99 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0022  hypothetical protein  31.87 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.45707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2546  protein of unknown function DUF323  33.25 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1756  hypothetical protein  30.6 
 
 		 420 aa  159  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.311507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2836  hypothetical protein  32.12 
 
 		 423 aa  159  9e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  29.54 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1407  hypothetical protein  33.01 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  35.4 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0611  protein of unknown function DUF323  33.26 
 
 		 425 aa  156  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3075  hypothetical protein  34.77 
 
 		 415 aa  156  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.467191  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3926  hypothetical protein  33.41 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3802  hypothetical protein  34.77 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.302646 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  32.86 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2198  hypothetical protein  32.56 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.687094 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1506  hypothetical protein  30.6 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1725  hypothetical protein  31.32 
 
 		 409 aa  153  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000255242 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  30.16 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2054  protein of unknown function DUF323  31.18 
 
 		 416 aa  153  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1619  hypothetical protein  29.02 
 
 		 398 aa  152  8e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.302981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  31.71 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0964  hypothetical protein  32.6 
 
 		 451 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2288  hypothetical protein  32.6 
 
 		 411 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  30.44 
 
 		 386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  29.64 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0030  hypothetical protein  33.41 
 
 		 448 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.434852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  27.77 
 
 		 385 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0951  hypothetical protein  32.55 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0893  protein of unknown function DUF323  32.54 
 
 		 432 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  31.38 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  29.19 
 
 		 383 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2287  hypothetical protein  33.26 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0155018 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.36 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1640  hypothetical protein  30.84 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1713  domain of unknown function  32.17 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  31.7 
 
 		 384 aa  143  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3207  hypothetical protein  31.72 
 
 		 407 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1598  hypothetical protein  29.8 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.785472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0015  hypothetical protein  32.39 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1587  protein of unknown function DUF323  33.41 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1581  methyltransferase  31.86 
 
 		 723 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.412044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0782  hypothetical protein  30.07 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.421239  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1050  hypothetical protein  32.02 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0023  hypothetical protein  30.91 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>