More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2108 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 		 536 aa  1064    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.12 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.67 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  30.64 
 
 		 562 aa  209  7e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  32.35 
 
 		 554 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  33.77 
 
 		 503 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  36.42 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0165  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.61 
 
 		 513 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.598052  normal  0.507079 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0205  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.8 
 
 		 530 aa  206  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.757466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  30.84 
 
 		 558 aa  206  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.66 
 
 		 512 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  30.31 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  31.48 
 
 		 555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.68 
 
 		 598 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  30.97 
 
 		 556 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1737  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.9 
 
 		 513 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  32.21 
 
 		 554 aa  200  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  31.33 
 
 		 553 aa  200  6e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  31.67 
 
 		 554 aa  199  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0725  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.69 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0343792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  29.94 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  30.9 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  31.89 
 
 		 554 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  31.82 
 
 		 554 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  32.16 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.56 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  34.2 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000194525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  29.62 
 
 		 554 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  33.97 
 
 		 554 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000795791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  32.12 
 
 		 554 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  33.97 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000278776  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  33.97 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000680527  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  33.97 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000271293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  33.97 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000498597  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  31.17 
 
 		 554 aa  193  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  31.17 
 
 		 554 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.97 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235931  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  29.62 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  0.000000000344711 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  31.17 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  33.97 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000880701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  30.54 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  29.72 
 
 		 556 aa  191  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  33.49 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000644319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  30.54 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  32.26 
 
 		 554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  30.33 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  31.48 
 
 		 554 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  32.26 
 
 		 554 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000823611  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3071  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.96 
 
 		 612 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165515  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  30.97 
 
 		 554 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  31.61 
 
 		 592 aa  188  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  31.29 
 
 		 537 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  31.05 
 
 		 554 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  31.82 
 
 		 594 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  31.77 
 
 		 554 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  31.77 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.18 
 
 		 514 aa  186  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  31.77 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  31.21 
 
 		 554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.46 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37560  asparagine synthetase, glutamine-hydrolysing  33.09 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.761947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  32.98 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  30.56 
 
 		 556 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  32.78 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  33.1 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  33.1 
 
 		 554 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2812  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.34 
 
 		 614 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.303301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  33.01 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  31.25 
 
 		 593 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  33.1 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.51 
 
 		 588 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  33.1 
 
 		 554 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  33.4 
 
 		 537 aa  181  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  29.7 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  34.04 
 
 		 563 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  31.77 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  31.75 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000801379  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  33.72 
 
 		 563 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1627  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.85 
 
 		 615 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.24 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0556  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.31 
 
 		 613 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.464828  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4250  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.02 
 
 		 619 aa  173  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.210666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  29.52 
 
 		 592 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  30.28 
 
 		 571 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0993  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.28 
 
 		 617 aa  170  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000224185  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  30.34 
 
 		 589 aa  170  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.34 
 
 		 595 aa  169  8e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.32 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  30.15 
 
 		 589 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.15 
 
 		 591 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2257  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  31.86 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1299  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  28.97 
 
 		 613 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00294849  normal  0.177591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  31.29 
 
 		 530 aa  166  6.9999999999999995e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1828  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  26.64 
 
 		 607 aa  166  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.433581  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.42 
 
 		 602 aa  166  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>