More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2072 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  803    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  36.44 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 427 aa  219  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 420 aa  117  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.15 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 437 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  32.48 
 
 		 445 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 397 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 406 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 447 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  29.68 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  32.03 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  32.63 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  24.45 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  25.63 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  30.29 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.26 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  30.72 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.78 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.68 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  28.78 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  27.61 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  24.67 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  24.12 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  22.56 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24.12 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  24.23 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.77 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.73 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.23 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.94 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.56 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.57 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.15 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.56 
 
 		 404 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  27.09 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.57 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  29.14 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.39 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  27.09 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.73 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  25.9 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.73 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.73 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.34 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.22 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.4 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  27.86 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 423 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>