More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1921 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1921  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.137486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1912  NUDIX hydrolase  87.56 
 
 		 201 aa  341  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255381  hitchhiker  0.000304952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1519  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 		 220 aa  192  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000389624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1133  NUDIX hydrolase  54.64 
 
 		 225 aa  186  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2348  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00912328  normal  0.0106592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1755  NUDIX hydrolase  55.84 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0106102  hitchhiker  0.000762275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1520  NUDIX hydrolase  53.51 
 
 		 220 aa  183  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.234445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25410  NTP pyrophosphohydrolase  54.97 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.584509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1488  NUDIX hydrolase  49.75 
 
 		 212 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.587819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22070  NTP pyrophosphohydrolase  55.19 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3140  NUDIX hydrolase  51.63 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511935  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3156  NUDIX hydrolase  52.5 
 
 		 207 aa  174  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.38817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1348  NUDIX hydrolase  58.85 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2822  NUDIX hydrolase  51.98 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.38785  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4431  NUDIX hydrolase  55.25 
 
 		 188 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2376  NUDIX hydrolase  48.76 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2958  NUDIX hydrolase  53.11 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.682992  normal  0.58041 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2943  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2987  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3282  NUDIX hydrolase  53.98 
 
 		 211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4063  NUDIX hydrolase  48.6 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0818284  normal  0.284545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5434  NUDIX hydrolase  56.02 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000494994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3501  NUDIX hydrolase  53.41 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.368602  normal  0.313364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5410  NUDIX hydrolase  50.56 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.999676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3000  NUDIX hydrolase  48.88 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2991  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2835  NUDIX hydrolase  50.51 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0310181  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14200  NUDIX family protein  44.85 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0659704  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1665  NUDIX hydrolase  55.11 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0528877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11715  hypothetical protein  48.02 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.191182 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1242  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.141201  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13740  NTP pyrophosphohydrolase  48.7 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1200  hypothetical protein  53.26 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.552549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1504  NUDIX hydrolase  43.98 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1552  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1753  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 180 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0970  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1325  NUDIX hydrolase  43.71 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  45.4 
 
 		 281 aa  122  3e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0555  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00848301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06830  ADP-ribose pyrophosphatase  37.79 
 
 		 176 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1901  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 178 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1829  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 176 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0819  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 180 aa  119  3e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0674  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0138639  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1905  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000619655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0447  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2263  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2595  NUDIX hydrolase  34.08 
 
 		 176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000152881  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2011  NUDIX hydrolase  35.91 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1342  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000039196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0362  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4204  mutT/nudix family protein  34.78 
 
 		 179 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1694  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 177 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.204755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0597  NUDIX hydrolase  37.13 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2233  NUDIX hydrolase  35.84 
 
 		 199 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1886  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 		 172 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.556059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2793  NUDIX hydrolase  32.92 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4004  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.731081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3837  ADP-ribose diphosphatase  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3851  ADP-ribose diphosphatase  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4118  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177311 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4316  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.875524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4227  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.057791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1556  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1587  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 		 180 aa  105  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.356936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4163  mutT/nudix family protein  34.46 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1134  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2794  NUDIX hydrolase  40.78 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 179 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0414  NTP pyrophosphohydrolase  40.83 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.136585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2065  NUDIX family hydrolase  31.36 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.862102  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1927  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00211801  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2078  NUDIX family hydrolase  34.32 
 
 		 194 aa  101  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  38.92 
 
 		 176 aa  101  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2486  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.253943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2046  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3199  ADP-ribose phosphorylase  36.42 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12410  NUDIX family protein  45.93 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274172  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1638  NUDIX hydrolase  32.1 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1757  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.335075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1754  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1779  adp-ribose pyrophosphatase  32.52 
 
 		 176 aa  99.8  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1515  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1076  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.42 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0942  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 		 211 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0048  NUDIX hydrolase  38.01 
 
 		 173 aa  99  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.642128 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0835  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.773833  normal  0.937872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0076  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 184 aa  98.2  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.655363 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2896  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 166 aa  98.2  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1024  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 		 180 aa  97.8  8e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00585419  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1418  ADP-ribose pyrophosphatase  39.31 
 
 		 207 aa  98.2  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.656759  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0948  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1194  NUDIX family hydrolase  29.45 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3624  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0176  NUDIX hydrolase  37.71 
 
 		 173 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0982781  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0722  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.84 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1358  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  hitchhiker  0.00856079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>