178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1893 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1893  arginine repressor  100 
 
 		 172 aa  333  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.547671  normal  0.237539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1886  arginine repressor, ArgR  95.27 
 
 		 171 aa  286  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00411801  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3023  arginine repressor, ArgR  62.96 
 
 		 178 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3525  arginine repressor  61.49 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.4949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25580  transcriptional regulator, ArgR family  57.4 
 
 		 171 aa  177  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5451  arginine repressor, ArgR  61.39 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0981775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2982  arginine repressor  61.54 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.57885  normal  0.044902 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2398  arginine repressor, ArgR  60.65 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2967  arginine repressor  61.54 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3011  arginine repressor  61.54 
 
 		 159 aa  168  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.600115 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3309  arginine repressor  61.84 
 
 		 161 aa  167  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0125249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11675  arginine repressor  61.69 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.20822e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2473  arginine repressor  53.49 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2156  arginine repressor, ArgR  55.41 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000822045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2053  arginine repressor  53.57 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.182816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22280  transcriptional regulator, ArgR family  56.17 
 
 		 175 aa  154  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.772386  normal  0.886844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5466  arginine repressor  57.62 
 
 		 168 aa  153  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.738958  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1646  arginine repressor, ArgR  53.94 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2026  arginine repressor ArgR  54.32 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.518253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4126  arginine repressor, ArgR  62.82 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10236  hitchhiker  0.0000243081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1501  arginine repressor  50.87 
 
 		 186 aa  147  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2368  arginine repressor, ArgR  55.06 
 
 		 184 aa  147  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.936664  hitchhiker  0.0059772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2836  arginine repressor  61.04 
 
 		 172 aa  147  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122938  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10120  transcriptional regulator, ArgR family  53.9 
 
 		 188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1502  arginine repressor  54.3 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000136433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3067  arginine repressor, ArgR  61.35 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.441521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1116  arginine repressor, ArgR  48.33 
 
 		 195 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.503048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1258  ArgR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 184 aa  144  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0356783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1332  arginine repressor, ArgR  51.53 
 
 		 172 aa  143  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0268167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3156  arginine repressor  51.52 
 
 		 184 aa  141  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3056  arginine repressor, ArgR  49.68 
 
 		 177 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132947  normal  0.798725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3170  ArgR family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 234 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0388533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6072  arginine repressor  50.32 
 
 		 167 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21690  transcriptional regulator, ArgR family  51.3 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.253364  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1742  arginine repressor, ArgR  52.98 
 
 		 189 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0017148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14370  transcriptional regulator, ArgR family  46.91 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3484  arginine repressor, ArgR  42.67 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1395  arginine repressor, ArgR  45.83 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1030  arginine repressor, ArgR  41.72 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.507281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0815  ArgR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0811  Arginine repressor  39.26 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0949  arginine repressor  38.16 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000274725  decreased coverage  0.00000185245 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4285  arginine repressor  38.16 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2317  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4247  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4305  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4079  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000890152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3917  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.90108e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3928  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183024  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4398  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000191552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4195  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.2845299999999995e-37 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2868  arginine repressor  37.5 
 
 		 149 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.904403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0253  arginine repressor  38.82 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0673  arginine repressor, C-terminal domain protein  41.43 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4027  arginine repressor  38.16 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000656189  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2580  arginine repressor, ArgR  36.36 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1660  arginine repressor, ArgR  47.02 
 
 		 160 aa  98.6  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.442675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1083  arginine repressor, ArgR  37.66 
 
 		 152 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06560  arginine repressor, ArgR  34.9 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212606  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1579  arginine repressor  34.87 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.650856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1612  arginine repressor  34.87 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000014765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1543  arginine repressor  37.58 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1081  arginine repressor  36.3 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1897  arginine repressor, ArgR  36.5 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000423478  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0546  arginine repressor, ArgR  32.9 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000103861  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0560  arginine repressor, ArgR  32.9 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0405896  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1508  ArgR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 151 aa  92.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02280  arginine repressor  35.71 
 
 		 144 aa  90.9  8e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4162  ArgR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00922797  normal  0.12838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0585  arginine repressor  34.25 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0631  arginine repressor, ArgR  45.11 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2160  ArgR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 161 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1321  arginine repressor, ArgR  39.87 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0991989 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04740  arginine repressor  40.88 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.159421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2340  arginine repressor, ArgR  36.03 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1074  arginine repressor, ArgR  36.81 
 
 		 149 aa  84.7  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2102  arginine repressor ArgR, putative  34.21 
 
 		 145 aa  84.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2316  arginine repressor, ArgR  41.06 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2508  arginine repressor, ArgR  34 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0153884  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1784  arginine repressor  33.79 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2070  arginine repressor  33.79 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.625599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1011  arginine repressor, ArgR  37.78 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1334  arginine repressor, ArgR  35.33 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0613  arginine repressor, ArgR  44.88 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0413371  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0621  arginine repressor, ArgR  44.88 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1333  arginine repressor, ArgR  34.78 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00615328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0406  arginine repressor  28.48 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0446  ArgR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0471  arginine repressor  27.81 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0340  arginine repressor  27.81 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2095  arginine repressor, ArgR  34.67 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0776  arginine repressor  37.14 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.668577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0347  arginine repressor, ArgR  28.95 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0586  ArgR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0066  arginine repressor  34.56 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.558575  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4899  arginine repressor  26.49 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0419  arginine repressor  26.49 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2363  arginine repressor, ArgR  31.54 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1214  ArgR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.277235  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1379  arginine repressor, ArgR  33.56 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>