More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1867 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1867  cytochrome P450  100 
 
 
423 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1860  cytochrome P450  82.74 
 
 
421 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175723  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  49.63 
 
 
409 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6190  cytochrome P450  48.53 
 
 
406 aa  335  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4939  cytochrome P450  46.8 
 
 
404 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  43.24 
 
 
408 aa  298  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  42.86 
 
 
408 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  44.19 
 
 
402 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  43.61 
 
 
401 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4666  cytochrome P450  46.04 
 
 
450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  42.07 
 
 
410 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  43.54 
 
 
423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  39.85 
 
 
406 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  38.06 
 
 
411 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  43.1 
 
 
418 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  37.65 
 
 
412 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  41.34 
 
 
398 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  40.4 
 
 
414 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  40.25 
 
 
402 aa  263  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  37.83 
 
 
412 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  39.39 
 
 
405 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  38.94 
 
 
417 aa  259  9e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  38.94 
 
 
409 aa  259  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  39.07 
 
 
406 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  37.97 
 
 
417 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  40.1 
 
 
407 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  39.76 
 
 
429 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  39.85 
 
 
407 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  37.84 
 
 
405 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  42.46 
 
 
402 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  39.08 
 
 
413 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  39.02 
 
 
405 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  38.36 
 
 
407 aa  251  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  37.91 
 
 
408 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.42 
 
 
411 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  38.59 
 
 
423 aa  249  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  37.24 
 
 
404 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2217  cytochrome P450  39.9 
 
 
417 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000207738  decreased coverage  0.000000904548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  37.66 
 
 
421 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  41.52 
 
 
416 aa  247  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  38.56 
 
 
399 aa  247  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  35.68 
 
 
396 aa  247  3e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  40.05 
 
 
399 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  36.13 
 
 
402 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  37.2 
 
 
410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  39.21 
 
 
409 aa  246  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.17 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2495  cytochrome P450  38.93 
 
 
464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.209676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1451  cytochrome P450  39.15 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.729337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  38.46 
 
 
417 aa  244  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  35.62 
 
 
402 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  33.92 
 
 
420 aa  243  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  41.16 
 
 
426 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  38.14 
 
 
400 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  39.42 
 
 
405 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  36.91 
 
 
400 aa  241  1e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  36.18 
 
 
398 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  40.7 
 
 
411 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  37.25 
 
 
407 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  36.69 
 
 
447 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  40.56 
 
 
398 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  38.29 
 
 
413 aa  239  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  36.45 
 
 
447 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  36.45 
 
 
447 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  36.41 
 
 
399 aa  237  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  37.29 
 
 
419 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  36.04 
 
 
413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3645  cytochrome P450  39.29 
 
 
429 aa  236  7e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  39.59 
 
 
422 aa  236  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  37.53 
 
 
411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  34.43 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0077  cytochrome P450  37.56 
 
 
410 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  40 
 
 
392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  38.06 
 
 
412 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  34.58 
 
 
411 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  35.01 
 
 
411 aa  233  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  34.58 
 
 
411 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  38.94 
 
 
468 aa  232  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0600  cytochrome P450  36.23 
 
 
443 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.441621  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  35.01 
 
 
411 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  35.01 
 
 
411 aa  230  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2825  cytochrome P450  36.83 
 
 
430 aa  229  5e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  38.54 
 
 
407 aa  229  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  41.71 
 
 
417 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  34.76 
 
 
411 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  41.07 
 
 
398 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  38.75 
 
 
412 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.53 
 
 
388 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  34.26 
 
 
411 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  34.26 
 
 
411 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  34.01 
 
 
411 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  40.15 
 
 
414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  40.61 
 
 
419 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  36.32 
 
 
436 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  43.22 
 
 
423 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  36.98 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  35.22 
 
 
408 aa  222  8e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.91 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3940  cytochrome P450  38.37 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>