More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1828 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 887 aa  640    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 875 aa  670    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 878 aa  648    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 878 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 895 aa  887    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 889 aa  1017    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 876 aa  672    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 896 aa  847    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 897 aa  944    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 876 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.23 
 
 		 897 aa  862    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 882 aa  637    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 874 aa  669    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 895 aa  932    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  57.91 
 
 		 889 aa  974    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  60.38 
 
 		 889 aa  1008    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  56.35 
 
 		 888 aa  926    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 883 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 		 889 aa  968    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 882 aa  643    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 876 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 878 aa  646    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  57.97 
 
 		 888 aa  971    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3925  alanyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 905 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.013428  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 890 aa  946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  55.2 
 
 		 893 aa  918    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 876 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3784  alanyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 		 905 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0683735  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  62.6 
 
 		 881 aa  999    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 878 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  47.84 
 
 		 894 aa  774    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3839  alanyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 905 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.538554  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  54.32 
 
 		 900 aa  896    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 879 aa  685    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  54.17 
 
 		 903 aa  868    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 892 aa  1001    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 898 aa  897    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 		 893 aa  970    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 884 aa  638    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 892 aa  1797    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 897 aa  637    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 897 aa  863    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.66 
 
 		 879 aa  636    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 879 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 880 aa  683    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 895 aa  898    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 904 aa  839    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 902 aa  890    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 880 aa  685    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  95.74 
 
 		 892 aa  1679    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  60.7 
 
 		 890 aa  958    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 874 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 892 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 897 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 878 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 876 aa  649    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 886 aa  964    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 		 878 aa  643    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 879 aa  653    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  59.68 
 
 		 896 aa  963    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 893 aa  774    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.34 
 
 		 897 aa  863    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 890 aa  887    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 898 aa  866    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 876 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 		 891 aa  889    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 885 aa  1066    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  55.07 
 
 		 898 aa  872    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 897 aa  830    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 879 aa  633  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 881 aa  635  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 874 aa  635  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3738  alanyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 875 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4553  alanyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 897 aa  631  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 864 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07800  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 889 aa  630  1e-179  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0367295 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1120  alanyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 874 aa  631  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00495062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3223  alanyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 931 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 884 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3711  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 905 aa  631  1e-179  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296443  hitchhiker  0.000064855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3904  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 904 aa  629  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.639044  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 		 867 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0862  alanyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 877 aa  627  1e-178  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.74806  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 887 aa  628  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1906  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.206627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3633  alanyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511669  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0850  alanyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 874 aa  625  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 874 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 877 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 877 aa  622  1e-177  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1613  alanyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 874 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 875 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 874 aa  619  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 902 aa  621  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 874 aa  621  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0797  alanyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 884 aa  617  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 877 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1957  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 884 aa  619  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103878  normal  0.2106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>