More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1824 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 477 aa  944    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  91.84 
 
 		 502 aa  817    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  72.77 
 
 		 448 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  63.4 
 
 		 446 aa  545  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  66.82 
 
 		 448 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  63.08 
 
 		 429 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  66.67 
 
 		 445 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  63.49 
 
 		 456 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  64.3 
 
 		 494 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  69.03 
 
 		 457 aa  514  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  63.38 
 
 		 461 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  64.24 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  63.83 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  63.83 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  65.18 
 
 		 500 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  63.83 
 
 		 445 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  65.32 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  64.39 
 
 		 452 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  63.72 
 
 		 484 aa  495  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  64.85 
 
 		 436 aa  495  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  61.61 
 
 		 519 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  65.17 
 
 		 456 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  63.85 
 
 		 460 aa  488  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1685  AAA ATPase central domain protein  62.37 
 
 		 478 aa  482  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.471753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  64.54 
 
 		 465 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17650  Recombination protein MgsA  60.25 
 
 		 490 aa  479  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.397333  normal  0.0704378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1356  AAA ATPase central domain protein  61.85 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.873359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2375  recombination factor protein RarA  60.27 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  62.59 
 
 		 441 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  62.65 
 
 		 456 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1814  AAA ATPase central domain protein  62.56 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0501821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  61.1 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2283  recombination factor protein RarA  60.55 
 
 		 474 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243633  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  59.86 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2019  recombination factor protein RarA  60.65 
 
 		 466 aa  450  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000217538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 		 450 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  49.05 
 
 		 447 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 435 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 441 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  53.28 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0041  recombination factor protein RarA  54.11 
 
 		 459 aa  412  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.481618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0826  recombination factor protein RarA  50.45 
 
 		 462 aa  402  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  48.93 
 
 		 435 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12450  Recombination protein MgsA  61.19 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.101973  normal  0.0965428 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  49.4 
 
 		 432 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  49.76 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  45.77 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 438 aa  395  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  51.54 
 
 		 458 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  46.96 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.73 
 
 		 739 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  49.64 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  50.12 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  50.24 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  47.07 
 
 		 448 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  49.51 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 457 aa  371  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  46.28 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  48.18 
 
 		 432 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  50.37 
 
 		 435 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  48.11 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.72 
 
 		 731 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50.85 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  46.17 
 
 		 447 aa  366  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  45.43 
 
 		 441 aa  363  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  47.23 
 
 		 734 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.87 
 
 		 463 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  48.8 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  46.1 
 
 		 432 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.22 
 
 		 726 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 437 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  46.99 
 
 		 734 aa  362  6e-99  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 437 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  48.43 
 
 		 457 aa  362  8e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  362  9e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  47.26 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  46.76 
 
 		 432 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  42.82 
 
 		 443 aa  359  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  49.52 
 
 		 459 aa  359  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.23 
 
 		 735 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.09 
 
 		 485 aa  358  9.999999999999999e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  43.59 
 
 		 440 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  49.08 
 
 		 505 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  43.71 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  45.56 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  47.16 
 
 		 454 aa  355  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  49.01 
 
 		 447 aa  352  8e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  48.07 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  48.23 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  47.26 
 
 		 423 aa  349  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  45.26 
 
 		 447 aa  349  5e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  45.43 
 
 		 426 aa  349  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  44.72 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.66 
 
 		 721 aa  345  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>