70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1822 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  100 
 
 		 198 aa  396  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  92.86 
 
 		 198 aa  335  1.9999999999999998e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  40.98 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  42.13 
 
 		 180 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  36.16 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  40.64 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  41.62 
 
 		 195 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  39.46 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  37.57 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  37.16 
 
 		 216 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  41.62 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.23 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  34.72 
 
 		 232 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  38.89 
 
 		 192 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  39.41 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  36.52 
 
 		 224 aa  91.3  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.53 
 
 		 196 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  36.36 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.55 
 
 		 213 aa  84.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  36.49 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  32.79 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  38.95 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  51.52 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  28.77 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  55.38 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  32.57 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  29.56 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  34.64 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 102 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  43.08 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  30.19 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4550  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.167859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  33.8 
 
 		 306 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  38.89 
 
 		 107 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.89 
 
 		 105 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 107 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5343  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 		 107 aa  45.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3941  putative transcriptional regulator, ArsR family  37.84 
 
 		 107 aa  44.7  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2260  transcriptional regulator, ArsR family  36.71 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1059  normal  0.463419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1280  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.514491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0506  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  39.44 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0873  ArsR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.107087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0660  ArsR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 96 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.410209  normal  0.0250069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2289  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 109 aa  43.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00371607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3439  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 88 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0006  regulatory protein, ArsR  44.26 
 
 		 98 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 114 aa  42.4  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3254  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 106 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3577  transcriptional regulator, ArsR family  35.14 
 
 		 107 aa  42  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.919618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 115 aa  42  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2627  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 102 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.8267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 109 aa  41.6  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  40.91 
 
 		 109 aa  41.6  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3429  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 108 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.336331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  37.18 
 
 		 171 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.39 
 
 		 108 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3120  ArsR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  41.27 
 
 		 119 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>