More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1818 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1818  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 238 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.52487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1808  beta-lactamase domain-containing protein  94.54 
 
 		 238 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  62.61 
 
 		 231 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  64.85 
 
 		 229 aa  284  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  59.66 
 
 		 234 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  60.89 
 
 		 231 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3818  beta-lactamase domain-containing protein  61.34 
 
 		 231 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.419873  normal  0.0855026 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  58.8 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  55.88 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  55.51 
 
 		 245 aa  249  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  60.7 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3167  beta-lactamase domain protein  58.58 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0163096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  53.85 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15250  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.6 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00905017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  54.67 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1336  beta-lactamase domain-containing protein  52.19 
 
 		 256 aa  224  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.542543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2323  beta-lactamase domain-containing protein  52.47 
 
 		 222 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.420202  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2284  beta-lactamase-like protein  52.47 
 
 		 222 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.459653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2331  beta-lactamase domain-containing protein  52.47 
 
 		 222 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995633  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  52.61 
 
 		 233 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  49.78 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15170  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.11 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.112325 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  49.55 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3810  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2589  beta-lactamase domain-containing protein  47.11 
 
 		 225 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0687061  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  38.91 
 
 		 205 aa  154  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  38.01 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1082  beta-lactamase domain protein  43.64 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  37.67 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  38.12 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 216 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  35.14 
 
 		 206 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  41.12 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.83 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1679  beta-lactamase domain protein  45.5 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.132867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  42.18 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  41.1 
 
 		 218 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  39.91 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  39.91 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 215 aa  135  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  39.45 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  34.23 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  40.48 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  40 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  39.81 
 
 		 209 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  38.79 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  39.17 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  38.36 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  36.44 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  39.45 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  37.1 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  37.1 
 
 		 241 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  35.29 
 
 		 209 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  37.1 
 
 		 214 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1805  beta-lactamase domain protein  41.88 
 
 		 238 aa  128  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0524123  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  37.56 
 
 		 214 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  38.77 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  38.99 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  36.24 
 
 		 212 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  37.33 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  37.05 
 
 		 240 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  37.39 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.1 
 
 		 210 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 215 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  37.22 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 209 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  36.2 
 
 		 209 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  37.27 
 
 		 214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  35.68 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3655  beta-lactamase domain-containing protein  36.41 
 
 		 211 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.11 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 209 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37 
 
 		 212 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  37.14 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  37.62 
 
 		 209 aa  124  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  36.57 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3552  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 483 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  39.45 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  35.27 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7673  metallo-hydrolase/oxidoreductase domain-containing protein  35.87 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  35.35 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  34.82 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  36.24 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  36.7 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  34.98 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  37.67 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.72 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0571  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>