More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1811 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  86.61 
 
 		 112 aa  194  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  45.36 
 
 		 121 aa  93.6  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0530  protein translocase subunit yajC  43.27 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  48.81 
 
 		 108 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  40.91 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  55.26 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  48.75 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  48.31 
 
 		 105 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  45.83 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  48.75 
 
 		 86 aa  83.6  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  47.06 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  47.06 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  48.84 
 
 		 94 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 106 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  42.68 
 
 		 105 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  43.82 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  43.82 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  43.68 
 
 		 117 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  41.57 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5120  preprotein translocase, YajC subunit  45.35 
 
 		 92 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  46.15 
 
 		 110 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  46.15 
 
 		 86 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  47.67 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  46.25 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  42.7 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  38.2 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  47.44 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  43.9 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  45.24 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  42.35 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  48.1 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  44.71 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  41.86 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  40.45 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  47.37 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  42.22 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  45.35 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0192  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  42.72 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  44.19 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0168  preprotein translocase subunit YajC  45.68 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.53 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  45.24 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  42.86 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  41.76 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  45.05 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  45.24 
 
 		 108 aa  75.5  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  39.33 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  45.26 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  41.11 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  43.02 
 
 		 91 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  45.05 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  42.05 
 
 		 103 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  41.05 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.89 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  41.56 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  38.68 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  36.63 
 
 		 114 aa  75.1  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  43.21 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  43.59 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  44.58 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  38.96 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1332  preprotein translocase, YajC subunit  43.68 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0235382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 90 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1000  preprotein translocase, YajC subunit  47.44 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.492649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1304  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  39.78 
 
 		 109 aa  72  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  37.8 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12280  preprotein translocase, YajC subunit  41.56 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  42.86 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>