More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1785 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1785  elongation factor G  100 
 
 		 717 aa  1416    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5155  elongation factor G  58.02 
 
 		 674 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212266  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5517  elongation factor G  60.5 
 
 		 713 aa  809    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.469673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2340  elongation factor G  63.37 
 
 		 729 aa  853    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.468158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0872  elongation factor G  64.4 
 
 		 722 aa  835    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0290  small GTP-binding protein  53.05 
 
 		 770 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10121  elongation factor G  60.33 
 
 		 714 aa  822    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2099  small GTP-binding protein  64.27 
 
 		 719 aa  899    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00285281  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1361  elongation factor G  54.94 
 
 		 722 aa  703    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2404  small GTP-binding protein  69.32 
 
 		 718 aa  1033    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136608  normal  0.0116105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5136  elongation factor G  60.5 
 
 		 713 aa  809    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1772  elongation factor G  93.58 
 
 		 717 aa  1335    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.228015  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2732  small GTP-binding protein  60.29 
 
 		 696 aa  720    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556066  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2028  elongation factor G  65.03 
 
 		 726 aa  861    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3802  elongation factor G  53.99 
 
 		 729 aa  708    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.812471  normal  0.705979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2075  small GTP-binding protein  63.78 
 
 		 708 aa  895    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.934925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1356  elongation factor G  63.73 
 
 		 719 aa  887    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.335605 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4599  elongation factor G  58.22 
 
 		 701 aa  769    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.463727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5225  elongation factor G  60.5 
 
 		 713 aa  809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.526168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2107  elongation factor G  72.8 
 
 		 741 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000230841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6127  elongation factor G  62.97 
 
 		 710 aa  834    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220969  normal  0.933466 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0832  translation elongation factor G  37.84 
 
 		 695 aa  485  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3663  translation elongation factor G  40.37 
 
 		 690 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0010  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  34.81 
 
 		 692 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1453  elongation factor G  40.58 
 
 		 677 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.259372  normal  0.118188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2815  elongation factor G  35.28 
 
 		 697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1229  translation elongation factor G  36.74 
 
 		 673 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0505633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1831  elongation factor G  36.4 
 
 		 694 aa  451  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000276436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1794  elongation factor G  35.59 
 
 		 695 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1045  translation elongation factor G  35.78 
 
 		 696 aa  452  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1113  translation elongation factor G  37.86 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.862086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0096  elongation factor G  34.95 
 
 		 696 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1152  elongation factor G  34.73 
 
 		 682 aa  442  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000572853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1022  elongation factor G  38.05 
 
 		 683 aa  441  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0074  elongation factor G  35.04 
 
 		 696 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0068  elongation factor G  35.79 
 
 		 691 aa  442  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.480211  normal  0.213325 
 
 
-
 
NC_002936  DET1212  elongation factor G  38.57 
 
 		 686 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1142  elongation factor G  37.52 
 
 		 680 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.283647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1762  translation elongation factor G  35.1 
 
 		 667 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.352706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2318  elongation factor G  33.86 
 
 		 701 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.866261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1367  translation elongation factor G  36.22 
 
 		 670 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560984 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1319  elongation factor G  35.14 
 
 		 694 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0378966  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_995  translation elongation factor, GTPase  38.34 
 
 		 683 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0828  elongation factor G  35.35 
 
 		 679 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1969  elongation factor G  36.43 
 
 		 692 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.704236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1985  elongation factor G  34.05 
 
 		 697 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.786263  normal  0.270154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1140  translation elongation factor G  34.72 
 
 		 683 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.128625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2220  small GTP-binding protein  36.57 
 
 		 693 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.280963  normal  0.116101 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1905  elongation factor G  34 
 
 		 701 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.129196 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0204  small GTP-binding protein  34.83 
 
 		 682 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153237  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2972  translation elongation factor G  34.38 
 
 		 673 aa  429  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2318  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.06 
 
 		 682 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0656  elongation factor G  35.38 
 
 		 694 aa  429  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1933  elongation factor G  34.48 
 
 		 697 aa  424  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0407442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4111  small GTP-binding protein  37.87 
 
 		 697 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00902379 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2463  elongation factor G  36.43 
 
 		 692 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.691904  normal  0.0191825 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0947  translation elongation factor G, putative  35.82 
 
 		 692 aa  417  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.200709  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1178  translation elongation factor G  34.43 
 
 		 683 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.747201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1973  elongation factor G  34.57 
 
 		 690 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1289  translation elongation factor G  32.95 
 
 		 685 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2537  small GTP-binding protein  35.42 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0128296  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01140  translation elongation factor G  36.44 
 
 		 689 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000711404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0104  elongation factor G  36.06 
 
 		 689 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01510  small GTP-binding protein domain protein  35.32 
 
 		 687 aa  411  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2255  small GTP-binding protein  37.01 
 
 		 707 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000313892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0101  elongation factor G  35.67 
 
 		 692 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000583321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2879  elongation factor G  34.48 
 
 		 694 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.450791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09730  translation elongation factor G  33.81 
 
 		 688 aa  405  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2714  translation elongation factor G  35.3 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00080335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0809  elongation factor G  34.77 
 
 		 691 aa  404  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000920124  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0262  elongation factor G  34.38 
 
 		 692 aa  404  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000815728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4540  translation elongation factor G  37.93 
 
 		 701 aa  404  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0864  elongation factor G  34.29 
 
 		 689 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000306199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3702  small GTP-binding protein  40.92 
 
 		 687 aa  400  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.805436  normal  0.844675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0108  elongation factor G  35.39 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000924117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0102  elongation factor G  35.39 
 
 		 692 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000176822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1541  translation elongation factor G  33.67 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2741  elongation factor G  36.52 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.784554  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04690  small GTP-binding protein domain protein  36.23 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1188  elongation factor G  35.26 
 
 		 701 aa  402  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0978  translation elongation factor G  34.6 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00678136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0119  elongation factor G  35.1 
 
 		 692 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.92544e-59 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2098  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 656 aa  402  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2860  elongation factor G  34.81 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0281835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0188  elongation factor G  33.81 
 
 		 693 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000059659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0712  translation elongation factor G  34.96 
 
 		 697 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0107  elongation factor G  35.24 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0101  elongation factor G  35.1 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1527  translation elongation factor G  35.04 
 
 		 690 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000816454  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2225  elongation factor G  35.87 
 
 		 680 aa  399  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3028  elongation factor G  35.29 
 
 		 702 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263328  hitchhiker  0.000178878 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0107  elongation factor G  35.1 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000392838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0128  elongation factor G  35.24 
 
 		 692 aa  399  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000285485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2618  elongation factor G-like  37.55 
 
 		 693 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0138  elongation factor G  35.1 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000590247  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1660  translation elongation factor G  36.36 
 
 		 691 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00040628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4029  elongation factor G  35.24 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00578031  decreased coverage  0.000000445234 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5198  elongation factor G  35.1 
 
 		 692 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000109677  unclonable  1.5030900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0677  elongation factor G  33.8 
 
 		 692 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00774195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0191  translation elongation factor 2 (EF-2/EF-G)  33.62 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000112943  hitchhiker  0.00531332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>