76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1750 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1750  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  609  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  82.75 
 
 		 313 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  49.84 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0825  hypothetical protein  54.66 
 
 		 316 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  48.26 
 
 		 381 aa  264  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4120  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  42.69 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254972  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  30.49 
 
 		 328 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  31.48 
 
 		 327 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  29.94 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  30.86 
 
 		 327 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  32.42 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  30.61 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 314 aa  100  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  29.43 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  29.43 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 328 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  27.5 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 346 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  29.34 
 
 		 328 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  30 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 313 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 341 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.79 
 
 		 333 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 351 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  29.31 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  31.9 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  31.79 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  26.79 
 
 		 843 aa  72.8  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1276  putative NAD/FAD-dependent oxidoreductase  29.18 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.35 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  28.53 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  24.24 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 347 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1154  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  37.63 
 
 		 451 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  42.59 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  39.29 
 
 		 647 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  39.29 
 
 		 647 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  48.15 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0926  amine oxidase  50 
 
 		 435 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00368983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  58.97 
 
 		 645 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  38.24 
 
 		 647 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  37.93 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  34.67 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.3 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.3 
 
 		 450 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  36.28 
 
 		 447 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  38.36 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 344 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  36.84 
 
 		 442 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  41.67 
 
 		 448 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.14 
 
 		 556 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  28.43 
 
 		 432 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  43.28 
 
 		 415 aa  43.1  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  42.59 
 
 		 435 aa  43.1  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  39.44 
 
 		 418 aa  42.7  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>