More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1736 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  94.72 
 
 		 265 aa  509  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  64.09 
 
 		 259 aa  328  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1469  exodeoxyribonuclease III  62.06 
 
 		 282 aa  318  6e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.361239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1180  exodeoxyribonuclease III  59.7 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.287038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5290  exodeoxyribonuclease III Xth  60.08 
 
 		 297 aa  298  9e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.024265  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4608  exodeoxyribonuclease III Xth  58.3 
 
 		 261 aa  292  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  hitchhiker  0.0000204361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  56.39 
 
 		 293 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0258  exodeoxyribonuclease III  55.89 
 
 		 264 aa  288  7e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0433178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3648  exodeoxyribonuclease III Xth  55.98 
 
 		 263 aa  288  9e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0470  exodeoxyribonuclease III Xth  57.2 
 
 		 289 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0549  exodeoxyribonuclease III Xth  55.38 
 
 		 264 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4983  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 264 aa  278  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4159  exodeoxyribonuclease III Xth  54.2 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4198  exodeoxyribonuclease III Xth  55.94 
 
 		 266 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3153  exodeoxyribonuclease III Xth  54.23 
 
 		 264 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000272901  hitchhiker  0.000542598 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10432  exodeoxyribonuclease III protein xthA (exonuclease III)  55.3 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0709218  normal  0.817281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35330  Exodeoxyribonuclease III  50.77 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139332  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05580  Exodeoxyribonuclease III  53.16 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0579  exodeoxyribonuclease III  52.65 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.201053  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0557  exodeoxyribonuclease III  52.65 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0730  exodeoxyribonuclease III Xth  53.16 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0567  exodeoxyribonuclease III  52.65 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1079  exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 262 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0629  exodeoxyribonuclease III Xth  49.81 
 
 		 268 aa  252  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0177  exodeoxyribonuclease III Xth  51.67 
 
 		 272 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.990944 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2428  exodeoxyribonuclease III Xth  49.24 
 
 		 264 aa  249  3e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25800  Exodeoxyribonuclease III  49.62 
 
 		 266 aa  248  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.92681  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0419  exodeoxyribonuclease III  49.06 
 
 		 294 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0656  exodeoxyribonuclease III Xth  50.38 
 
 		 262 aa  242  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.512718  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01950  Exodeoxyribonuclease III  48.35 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  48.24 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1068  exodeoxyribonuclease III Xth  50.95 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.139383  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  42.25 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  41.47 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  45.1 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  43.92 
 
 		 254 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  45.24 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  42.75 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  43.19 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  45.24 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  43.92 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1727  exodeoxyribonuclease III Xth  50.57 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  46.46 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  46.46 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  43.7 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  36.98 
 
 		 281 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.31 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  43.14 
 
 		 254 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  42.37 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  44.02 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  43.31 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  34.69 
 
 		 281 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  43.31 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  42.91 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  36.76 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  41.25 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  41.76 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2622  exodeoxyribonuclease III Xth  47.43 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128111  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  41.04 
 
 		 282 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  41.22 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  41.34 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  42.11 
 
 		 269 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  40.94 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  41.73 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  42.11 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  41.6 
 
 		 275 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  42.47 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  42.47 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  38.4 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  38.7 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1886  putative Exodeoxyribonuclease III  40.7 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0111436  normal  0.144129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  38.7 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  40.38 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  39.78 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  40.38 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  39.47 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  41.34 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  39.38 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  36.15 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  39.78 
 
 		 282 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  41.34 
 
 		 274 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  43.14 
 
 		 254 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  37.84 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  40.61 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  40.82 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  34.46 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>