188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1705 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  92.93 
 
 
185 aa  351  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  82.16 
 
 
186 aa  319  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  76.22 
 
 
185 aa  307  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000023862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3672  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  83.22 
 
 
151 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  59.56 
 
 
182 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.56 
 
 
182 aa  223  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  59.56 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  58.56 
 
 
200 aa  216  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  41.8 
 
 
188 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  38.62 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.78 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.24 
 
 
183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.13 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  32.57 
 
 
177 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.7 
 
 
183 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.36 
 
 
180 aa  99  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.8 
 
 
167 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.24 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  32.28 
 
 
181 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.28 
 
 
188 aa  91.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  31.75 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  28.02 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 
188 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
190 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.05 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3200  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.66 
 
 
201 aa  81.3  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.83 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.02 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  33.33 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  32.02 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  33.68 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.24 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0285  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0711  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
176 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0366042  normal  0.491773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0489  deaminase-reductase domain-containing protein  35.11 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.684638  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  30.73 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.42 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.28 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.16 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  28.8 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.77 
 
 
189 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.57 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.89 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  35.4 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.9 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.65 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  29.57 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.19 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  27.42 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.38 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  30.37 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.14 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  32.99 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.42 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  29.03 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  27.42 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0902  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.35 
 
 
199 aa  69.3  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4567  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.95 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.89 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  27.42 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.63 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.54 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  31.77 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  29.1 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  29.89 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.65 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  32.22 
 
 
178 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3987  bifunctional deaminase-reductase-like  30.11 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68682  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.1 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.86 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  32.22 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.85 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253763  normal  0.175179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.37 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.37 
 
 
185 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  32.1 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  33.74 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.32 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1400  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.65 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  26.46 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.7 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
178 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  29.7 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  27.51 
 
 
180 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
187 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7858  hypothetical protein  30.93 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
192 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.23 
 
 
204 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.55 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>