191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1690 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 517 aa  1044    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  80.92 
 
 		 519 aa  813    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  60.24 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  62.08 
 
 		 540 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  54.62 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 		 516 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  37.03 
 
 		 859 aa  266  7e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 507 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 		 518 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  36.35 
 
 		 545 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  36.47 
 
 		 861 aa  164  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  31.61 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 377 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  24.1 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  23.67 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  23.03 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.03 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.97 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 405 aa  67  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  23.11 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.12 
 
 		 408 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  25.16 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.8 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  25.47 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  25.8 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 396 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2418  glycosyltransferase-like protein  25.2 
 
 		 388 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.252152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 380 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 405 aa  55.8  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 		 475 aa  55.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  26 
 
 		 373 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08670  hypothetical protein  28.07 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 		 370 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 		 375 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 417 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 403 aa  54.7  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 348 aa  54.7  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  27.65 
 
 		 349 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 397 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  30.2 
 
 		 416 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 		 386 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 395 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  31.74 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 376 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  20 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6507  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.961113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0084  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  28.3 
 
 		 344 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  20.12 
 
 		 377 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  24.31 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1919  glycosyl transferase group 1  27.45 
 
 		 407 aa  52  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854337 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  22 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 414 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 		 436 aa  50.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 381 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 376 aa  50.4  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  34.18 
 
 		 836 aa  50.1  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  23.04 
 
 		 340 aa  50.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0756  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 445 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.621398  hitchhiker  0.000561624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  20.92 
 
 		 377 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0657  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.589634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0670  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 376 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.83 
 
 		 377 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  25 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 		 384 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1381  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000217179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.73 
 
 		 371 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1562  glycosyl transferase, group 1  24.22 
 
 		 463 aa  48.5  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.515981 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  19.82 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  24.23 
 
 		 409 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  27.69 
 
 		 377 aa  48.5  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5066  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 375 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>