More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1688 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1688  glutamine--scyllo-inositol transaminase  100 
 
 
369 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1683  glutamine--scyllo-inositol transaminase  93.5 
 
 
369 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0415301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7630  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  61.1 
 
 
373 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409815  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08620  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  61.8 
 
 
370 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  59.5 
 
 
362 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21030  predicted PLP-dependent enzyme possibly involved in cell wall biogenesis  59.39 
 
 
369 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.9252  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0121  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  51.69 
 
 
358 aa  361  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0828  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  52.79 
 
 
365 aa  349  4e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1137  aspartate aminotransferase  50.42 
 
 
360 aa  345  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0812  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  47.09 
 
 
364 aa  333  3e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.317419  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2142  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.15 
 
 
362 aa  331  1e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.785412 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1460  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.63 
 
 
363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.594691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1834  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  45.43 
 
 
363 aa  311  1e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.272611  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0477  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  47.91 
 
 
364 aa  306  3e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0356  glutamine--scyllo-inositol transaminase  49.56 
 
 
371 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0205  glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.34 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.737866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0204  glutamine--scyllo-inositol transaminase  46.29 
 
 
385 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2233  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.58 
 
 
363 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6222  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  47.55 
 
 
367 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239921  normal  0.132866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3012  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.47 
 
 
481 aa  296  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3868  glutamine--scyllo-inositol transaminase  46.78 
 
 
372 aa  291  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.335317  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1135  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.78 
 
 
361 aa  290  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5180  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.54 
 
 
420 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0071  pleiotropic regulatory protein-like  46.13 
 
 
399 aa  288  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.237821  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6418  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.38 
 
 
367 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.50729  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.04 
 
 
357 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1748  glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.5 
 
 
377 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0724  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.03 
 
 
387 aa  281  1e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.297651  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0399  aminotransferase  46.27 
 
 
364 aa  280  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1398  glutamine--scyllo-inositol transaminase  45.93 
 
 
420 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1219  glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.7 
 
 
382 aa  278  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2874  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.97 
 
 
371 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0899  Cys/Met metabolism pyridoxal-phosphate-dependent enzyme  43.38 
 
 
382 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4290  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  46.13 
 
 
367 aa  278  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.226644  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03641  putative pleiotropic regulatory protein  41.19 
 
 
389 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0562447  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1650  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  41.46 
 
 
389 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  46.56 
 
 
371 aa  276  5e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.18877  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5774  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.48 
 
 
369 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3023  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.2 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1257  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  41.5 
 
 
364 aa  273  3e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.393773  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2810  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.07 
 
 
380 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4806  glutamine--scyllo-inositol transaminase  46.51 
 
 
368 aa  273  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213922  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1610  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.1 
 
 
367 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.988475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0280  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.71 
 
 
375 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2351  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.86 
 
 
366 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0214  putative pleiotropic regulatory protein  41.35 
 
 
413 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0781  glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.68 
 
 
425 aa  270  4e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196688  normal  0.5278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4428  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.87 
 
 
583 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3259  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  44.48 
 
 
372 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1483  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.48 
 
 
365 aa  266  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1325  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.25 
 
 
368 aa  266  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1968  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.48 
 
 
413 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0281049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1173  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.32 
 
 
364 aa  265  1e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2863  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.11 
 
 
376 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3233  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.11 
 
 
376 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.511782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1067  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.06 
 
 
366 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0766  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.57 
 
 
364 aa  263  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1353  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  37.87 
 
 
370 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2511  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.67 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.783199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0663  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.09 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.240838  normal  0.431325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3190  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.38 
 
 
366 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0836  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.39 
 
 
396 aa  262  8e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1174  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.03 
 
 
369 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.12286  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4196  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.76 
 
 
387 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1458  pleiotropic regulatory protein, putative  43.03 
 
 
369 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3194  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.77 
 
 
366 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4493  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.73 
 
 
370 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000221733  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25161  putative pleiotropic regulatory protein  40.43 
 
 
408 aa  260  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0689  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.27 
 
 
369 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.530508  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3037  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.07 
 
 
367 aa  260  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1698  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.06 
 
 
373 aa  259  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1239  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.04 
 
 
368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.868639  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1081  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.52 
 
 
390 aa  259  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.014867  normal  0.0169301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0790  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.5 
 
 
368 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0634  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  40.76 
 
 
374 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.797926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1514  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.94 
 
 
379 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2210  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.29 
 
 
368 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1237  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  36.87 
 
 
369 aa  255  8e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.101913  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0709  glutamine--scyllo-inositol transaminase  43.06 
 
 
368 aa  254  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0241  putative pleiotropic regulatory protein  39.41 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.819498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1754  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.21 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00293581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4343  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.93 
 
 
393 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.132516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1301  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  39.08 
 
 
373 aa  252  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1184  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  43.91 
 
 
366 aa  252  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4762  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.55 
 
 
383 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000017153  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03111  putative pleiotropic regulatory protein  39.13 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2262  pleiotropic regulatory protein  41.46 
 
 
363 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0890  nucleotide-sugar aminotransferase  40.5 
 
 
369 aa  251  1e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1929  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  42.07 
 
 
362 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0594  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  38.46 
 
 
372 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2941  Glutamine--scyllo-inositol transaminase  42.33 
 
 
374 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1125  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase family protein  40.22 
 
 
369 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3475  glutamine--scyllo-inositol transaminase  41.69 
 
 
364 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2204  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.67 
 
 
374 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3126  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.82 
 
 
368 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0703  pyridoxal phosphate-dependent enzyme  37.6 
 
 
394 aa  249  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000106143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4000  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  40.86 
 
 
376 aa  249  5e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.952082  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1589  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  38.16 
 
 
370 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3423  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  41.28 
 
 
366 aa  246  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0969116  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7035  DegT/DnrJ/EryC1/StrS aminotransferase  44.38 
 
 
365 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>