73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1619 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  63.82 
 
 		 455 aa  512  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  60.81 
 
 		 465 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000665337 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  61.93 
 
 		 464 aa  491  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  54.75 
 
 		 493 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  59.52 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  59.3 
 
 		 457 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  63.39 
 
 		 361 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  54.09 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  55.93 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  56 
 
 		 465 aa  428  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.91 
 
 		 479 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  54.26 
 
 		 462 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  56.36 
 
 		 464 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  0.0000519323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  52.92 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  52.33 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  55.79 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  54.7 
 
 		 557 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  51.32 
 
 		 454 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  52.25 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.85 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  55.15 
 
 		 462 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.68 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  53.66 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.76 
 
 		 505 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  51.82 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  49.36 
 
 		 461 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  53.47 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  53.11 
 
 		 489 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  51.28 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.32 
 
 		 462 aa  363  5.0000000000000005e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  51.57 
 
 		 476 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  53.32 
 
 		 496 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  56.01 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  51.28 
 
 		 464 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  51.21 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  50.32 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  51.08 
 
 		 446 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  51.87 
 
 		 477 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.49 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  47.97 
 
 		 466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  48.92 
 
 		 448 aa  309  6.999999999999999e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  52.17 
 
 		 415 aa  309  8e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  47.41 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  50.23 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  49.79 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.85 
 
 		 481 aa  189  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  38.66 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  36.72 
 
 		 476 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  34.35 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  37.84 
 
 		 523 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  35.89 
 
 		 532 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  34.72 
 
 		 477 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  35.81 
 
 		 501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.74 
 
 		 477 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.79 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  36.55 
 
 		 673 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  40.3 
 
 		 840 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  48.21 
 
 		 168 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  29.68 
 
 		 759 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.43 
 
 		 1296 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.25 
 
 		 767 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.74 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  33.13 
 
 		 1037 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  26.24 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  39.08 
 
 		 2160 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.07 
 
 		 884 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2405  hypothetical protein  26.52 
 
 		 601 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000140285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  27.95 
 
 		 852 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  32 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  35.51 
 
 		 717 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  45.16 
 
 		 1755 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  36.36 
 
 		 362 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>