More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1580 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1580  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
626 aa  1170    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.648046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1531  heavy metal translocating P-type ATPase  90.58 
 
 
626 aa  955    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4993  heavy metal translocating P-type ATPase  58.69 
 
 
775 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1385  heavy metal translocating P-type ATPase  60.61 
 
 
775 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0387619  normal  0.88801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1079  heavy metal translocating P-type ATPase  61.63 
 
 
774 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  61.63 
 
 
774 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.167715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1106  heavy metal translocating P-type ATPase  61.63 
 
 
774 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.966149  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1648  heavy metal translocating P-type ATPase  58.59 
 
 
764 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0284242  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4372  heavy metal translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
763 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4504  heavy metal translocating P-type ATPase  51.59 
 
 
763 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.500973 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5860  heavy metal translocating P-type ATPase  49.33 
 
 
763 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.608727  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1328  putative cation-transporting ATPase  49.07 
 
 
764 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6248  heavy metal translocating P-type ATPase  49.84 
 
 
763 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.676922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0722  heavy metal translocating P-type ATPase  47.29 
 
 
759 aa  473  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000328227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4803  heavy metal translocating P-type ATPase  59.35 
 
 
762 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457318  normal  0.13713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1234  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  49.34 
 
 
763 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1949  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
618 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2249  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
621 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3027  heavy metal translocating P-type ATPase  51.95 
 
 
611 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4621  heavy metal translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
599 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  49.67 
 
 
760 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.745522 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6233  heavy metal translocating P-type ATPase  49.22 
 
 
737 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3442  putative cation-transporting ATPase  48.02 
 
 
765 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.913125  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6169  heavy metal translocating P-type ATPase  51.39 
 
 
776 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8719  heavy metal translocating P-type ATPase  51.22 
 
 
802 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4656  heavy metal translocating P-type ATPase  46.96 
 
 
616 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.736872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4263  heavy metal translocating P-type ATPase  56 
 
 
791 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0323156  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3767  heavy metal translocating P-type ATPase  50.17 
 
 
780 aa  438  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0340  heavy metal translocating P-type ATPase  45.68 
 
 
661 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08040  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  50.36 
 
 
644 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.585954  normal  0.130967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.34 
 
 
627 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2083  heavy metal translocating P-type ATPase  46.49 
 
 
658 aa  422  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000592834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0917  heavy metal translocating P-type ATPase  45.94 
 
 
641 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1303  heavy metal translocating P-type ATPase  49.74 
 
 
646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2012  heavy metal translocating P-type ATPase  48.85 
 
 
629 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.442755  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0180  heavy metal translocating P-type ATPase  40.51 
 
 
602 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0078  cation transport ATPase  38.91 
 
 
593 aa  395  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.365296  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  51.83 
 
 
794 aa  391  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0394  heavy metal translocating P-type ATPase  49.35 
 
 
641 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.207329  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2566  heavy metal translocating P-type ATPase  49.92 
 
 
642 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.247146  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3593  heavy metal translocating P-type ATPase  50.18 
 
 
637 aa  368  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1826  cation transport ATPase  38.16 
 
 
630 aa  360  6e-98  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.296097  normal  0.0201631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0933  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
654 aa  340  7e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
737 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1352  cation transport ATPase  35.55 
 
 
719 aa  327  5e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
734 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1919  heavy metal translocating P-type ATPase  35.35 
 
 
647 aa  316  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 
707 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2145  heavy metal translocating P-type ATPase  36.77 
 
 
826 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0369842  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1839  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
625 aa  308  1.0000000000000001e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0041  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0055  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0058  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0364244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 
835 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195972  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
826 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
809 aa  298  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3859  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.13 
 
 
641 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.90046  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
728 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 
728 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  30.76 
 
 
641 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2322  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
637 aa  295  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.512408  normal  0.580673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1721  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 
822 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.404884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0453  heavy metal translocating P-type ATPase  34.05 
 
 
630 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.153075 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
833 aa  294  4e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2290  heavy metal translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
873 aa  293  5e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  30.91 
 
 
641 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1836  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.85 
 
 
808 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.048394 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  32.59 
 
 
783 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  30.76 
 
 
641 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  30.76 
 
 
641 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3987  heavy metal translocating P-type ATPase  38.05 
 
 
834 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0179821  normal  0.224268 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
797 aa  289  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  30.6 
 
 
641 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  30.6 
 
 
641 aa  288  2e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  39.89 
 
 
792 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  32.45 
 
 
641 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0388  cation-transporting ATPase, P-type  30.6 
 
 
641 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0009  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
743 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
673 aa  287  4e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.28 
 
 
805 aa  287  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6168  heavy metal translocating P-type ATPase  34.26 
 
 
861 aa  287  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702521  normal  0.346343 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4848  heavy metal-transporting ATPase  32.75 
 
 
641 aa  287  5e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  33.39 
 
 
751 aa  286  5.999999999999999e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
868 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2153  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
724 aa  286  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3641  heavy metal translocating P-type ATPase  37.57 
 
 
656 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  33.02 
 
 
850 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0475  heavy metal-transporting ATPase  32.45 
 
 
641 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1878  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
803 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  31.76 
 
 
712 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  31.49 
 
 
690 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7296  cadmium-exporting ATPase  36.05 
 
 
842 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.212618  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1348  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
643 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0452174  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  36.77 
 
 
1022 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  31.6 
 
 
712 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2214  heavy metal translocating P-type ATPase  35.03 
 
 
835 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0906  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
712 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>