219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1522 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  100 
 
 
429 aa  868  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  50.85 
 
 
424 aa  332  7e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  48.54 
 
 
411 aa  255  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  42.7 
 
 
394 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  35.14 
 
 
413 aa  175  1e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.7233e-11  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  29.44 
 
 
407 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  29.2 
 
 
401 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  30.65 
 
 
430 aa  160  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  31.86 
 
 
431 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.87 
 
 
444 aa  153  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  30.96 
 
 
441 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  31 
 
 
426 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  31.3 
 
 
405 aa  147  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  34.1 
 
 
391 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  30.24 
 
 
445 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  31.54 
 
 
430 aa  143  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  34.54 
 
 
423 aa  141  2e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  30.33 
 
 
433 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  28.24 
 
 
400 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  31.58 
 
 
423 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  31.9 
 
 
455 aa  135  1e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  30.77 
 
 
431 aa  133  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  31.38 
 
 
412 aa  132  2e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.11 
 
 
429 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  32.9 
 
 
404 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  30.15 
 
 
421 aa  130  4e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31.77 
 
 
411 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.87 
 
 
413 aa  129  8e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  32.1 
 
 
408 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  32.1 
 
 
408 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  32.1 
 
 
408 aa  129  1e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  29.92 
 
 
444 aa  128  2e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.92 
 
 
426 aa  127  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  30.46 
 
 
422 aa  127  5e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  30.83 
 
 
409 aa  126  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  31.58 
 
 
414 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  29.72 
 
 
428 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  31.41 
 
 
403 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  30.81 
 
 
440 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  27.76 
 
 
437 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  29.22 
 
 
438 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  27.99 
 
 
407 aa  122  2e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.91 
 
 
426 aa  121  2e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  30.22 
 
 
433 aa  119  8e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  29.22 
 
 
459 aa  118  2e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  31.13 
 
 
419 aa  118  2e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  29.62 
 
 
407 aa  117  4e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  31.93 
 
 
402 aa  117  4e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  31.51 
 
 
428 aa  115  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  29.1 
 
 
433 aa  114  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.73 
 
 
421 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.79 
 
 
426 aa  112  2e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.55 
 
 
417 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.55 
 
 
417 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.55 
 
 
417 aa  111  2e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  27.75 
 
 
470 aa  111  2e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.81 
 
 
419 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  31.35 
 
 
444 aa  109  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  30.15 
 
 
425 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  28.81 
 
 
415 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  31.56 
 
 
401 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  8.42595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.33 
 
 
426 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  26.94 
 
 
407 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.54 
 
 
419 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30 
 
 
424 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.76 
 
 
432 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  28.73 
 
 
416 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  28.46 
 
 
478 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  27.93 
 
 
409 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  27.82 
 
 
448 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  28.61 
 
 
434 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  29.02 
 
 
403 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  28.1 
 
 
410 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  29.41 
 
 
415 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  27.61 
 
 
402 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  25.75 
 
 
412 aa  99.8  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.76 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  26.03 
 
 
412 aa  99  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  26.52 
 
 
445 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  29.28 
 
 
443 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.99 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  26.61 
 
 
411 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.37 
 
 
420 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  27.7 
 
 
480 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  26.6 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  28.06 
 
 
390 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  26.89 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  30.41 
 
 
413 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  27.2 
 
 
447 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  29.43 
 
 
421 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.94 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.92 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  28.46 
 
 
413 aa  94  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  27.9 
 
 
413 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  26.01 
 
 
428 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  27.15 
 
 
411 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  28.06 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  27.62 
 
 
413 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  27.9 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  27.12 
 
 
432 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>