63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1511 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1511  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  320  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.523376  decreased coverage  0.00417665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1462  hypothetical protein  94.16 
 
 		 155 aa  286  6e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2806  hypothetical protein  31.17 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.681505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02225  hypothetical protein  31.79 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.479286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  32.88 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3663  hypothetical protein  33.03 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.173975  normal  0.574334 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10078  hypothetical protein  34.18 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.866988  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  31.72 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2400  ArsR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  28.67 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  26.8 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0167  hypothetical protein  29.46 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.287681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  28.17 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  34.94 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  29.53 
 
 		 169 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0969  hypothetical protein  31.65 
 
 		 153 aa  50.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.563081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5280  ArsR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840921  normal  0.204126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0167  hypothetical protein  30.72 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  28.47 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_003296  RS03185  hypothetical protein  32.56 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0441  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.388606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3538  hypothetical protein  35.71 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.306741  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4272  hypothetical protein  31.4 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.341622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3364  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4160  hypothetical protein  31.4 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  31.71 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  27.78 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2057  YuaC  30.56 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000122085  hitchhiker  0.000000369916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1369  transcriptional regulators-like protein  38.16 
 
 		 171 aa  48.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0611668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1829  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 178 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.140183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0735  hypothetical protein  34.52 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2572  ArsR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5231  hypothetical protein  31.4 
 
 		 214 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.468748 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0584  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4326  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  28.21 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0507  hypothetical protein  38.46 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3330  putative transcriptional regulator  34.52 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216044  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0493  hypothetical protein  32.56 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1167  transcription regulator  37.5 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.25103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0579  helix-turn-helix, type 11  29.07 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2992  conserved hypothetical protein; putative transcriptional regulatory protein  41.54 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4631  transcriptional regulator-like protein  32.14 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000043936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  31.25 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6537  putative transcriptional regulator protein  32.14 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3836  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.902876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4118  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  25.17 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3853  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3598  transcriptional regulator protein-like protein  31.58 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0687943 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6122  putative transcriptional regulator protein  30.95 
 
 		 192 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143906  normal  0.933768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2041  transcriptional regulators-like protein  32.93 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1692  transcriptional regulator-like protein  29.81 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.312717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3098  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2872  putative transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 186 aa  41.6  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.870058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  25.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03482  Helix-turn-helix, type 11  29.23 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3460  transcriptional regulator protein-like protein  36.92 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2178  hypothetical protein  25 
 
 		 187 aa  41.2  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1298  regulatory protein ArsR  28.99 
 
 		 192 aa  40.8  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  28.91 
 
 		 239 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>