More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1498 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_1498  monooxygenase, FAD-binding  100 
 
 
477 aa  949    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.106253  normal  0.474209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2841  putative rifampin monooxygenase  72.52 
 
 
475 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4133  pentachlorophenol monooxygenase  72.33 
 
 
479 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2013  monooxygenase FAD-binding  69.05 
 
 
475 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2748  monooxygenase FAD-binding protein  71.78 
 
 
489 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2661  monooxygenase, FAD-binding protein  70.46 
 
 
473 aa  654    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2691  monooxygenase, FAD-binding  70.46 
 
 
473 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1940  monooxygenase, FAD-binding  70.11 
 
 
489 aa  647    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2706  monooxygenase, FAD-binding  70.46 
 
 
473 aa  654    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133137 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4431  monooxygenase FAD-binding protein  66.38 
 
 
474 aa  619  1e-176  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.412484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4669  hypothetical protein  67.02 
 
 
515 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.679977  normal  0.120633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3217  monooxygenase FAD-binding protein  62.71 
 
 
488 aa  552  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0996184  hitchhiker  0.0000000987139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5796  putative monooxygenase  46.04 
 
 
494 aa  350  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.79596  normal  0.121142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1649  hypothetical protein  42.91 
 
 
497 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256973  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1484  hypothetical protein  41.72 
 
 
499 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115631  normal  0.323666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0090  hypothetical protein  44.42 
 
 
497 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0404  monooxygenase FAD-binding protein  44.81 
 
 
496 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1216  hypothetical protein  45.4 
 
 
486 aa  333  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.795806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0599  monooxygenase FAD-binding protein  41.46 
 
 
488 aa  333  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3543  monooxygenase FAD-binding  44.02 
 
 
489 aa  329  7e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1850  hypothetical protein  40.84 
 
 
497 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5384  monooxygenase FAD-binding  42.39 
 
 
506 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.297257  normal  0.119449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2422  hypothetical protein  41.82 
 
 
526 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.230317  normal  0.0556109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1342  monooxygenase FAD-binding protein  44.94 
 
 
496 aa  312  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2199  monooxygenase, FAD-binding  42.6 
 
 
492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2196  monooxygenase, FAD-binding  42.54 
 
 
503 aa  297  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3332  hypothetical protein  41.2 
 
 
567 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.994828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2166  oxygenase  40 
 
 
522 aa  273  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2188  monooxygenase, FAD-binding  38.06 
 
 
503 aa  270  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.053184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8778  putative monooxygenase  42.28 
 
 
492 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2189  monooxygenase, FAD-binding  37.75 
 
 
490 aa  262  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0791667  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4465  putative oxygenase  38.46 
 
 
578 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164502  normal  0.0132982 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2639  putative oxygenase  38.22 
 
 
515 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166208 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2055  monooxygenase, FAD-binding  39.29 
 
 
486 aa  256  7e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0161  monooxygenase FAD-binding protein  39.66 
 
 
493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2162  monooxygenase FAD-binding  37.55 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.351168  decreased coverage  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0750  monooxygenase FAD-binding protein  39.62 
 
 
485 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3079  monooxygenase FAD-binding protein  38.45 
 
 
503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.591797  normal  0.0830218 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2459  monooxygenase FAD-binding  36.8 
 
 
509 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.985145  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3131  PheA/TfdB family FAD-binding monooxygenase  33.98 
 
 
483 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4514  monooxygenase FAD-binding  37.2 
 
 
508 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4203  monooxygenase FAD-binding  41.33 
 
 
487 aa  241  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0743  monooxygenase, FAD-binding  38.94 
 
 
509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0301082 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0013  putative monooxygenase  37.28 
 
 
519 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.738381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1818  YhjG  33.55 
 
 
483 aa  238  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.214491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2589  monooxygenase FAD-binding  37.6 
 
 
506 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388814  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2809  monooxygenase FAD-binding  36.99 
 
 
518 aa  237  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0721034  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2585  monooxygenase FAD-binding protein  37.65 
 
 
479 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1223  putative rifampin monooxygenase  38.45 
 
 
471 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247853  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6230  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 
499 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994902  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1544  monooxygenase, FAD-binding protein  35.88 
 
 
478 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.585572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1567  monooxygenase, FAD-binding  35.88 
 
 
478 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2328  monooxygenase FAD-binding  37.76 
 
 
480 aa  229  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.238819  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2198  monooxygenase, FAD-binding  37.87 
 
 
479 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.695646  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3504  monooxygenase FAD-binding  38.86 
 
 
515 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1515  monooxygenase, FAD-binding  36.46 
 
 
478 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3551  monooxygenase FAD-binding  39.54 
 
 
630 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412652  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2512  monooxygenase FAD-binding  35.43 
 
 
544 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2905  FAD-dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
548 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2966  FAD-dependent oxidoreductase  35.9 
 
 
548 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3068  monooxygenase FAD-binding  39.59 
 
 
493 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.159708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3293  monooxygenase FAD-binding  40.25 
 
 
486 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247977  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3014  oxygenase  35.9 
 
 
611 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0969  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.53 
 
 
548 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2598  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.53 
 
 
548 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0452  pentachlorophenol 4-monooxygenase, putative  35.28 
 
 
538 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0178  putative pentachlorophenol 4-monooxygenase  35.28 
 
 
538 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.74497  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2227  monooxygenase FAD-binding  38.63 
 
 
552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.465072  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1676  monooxygenase FAD-binding protein  35.23 
 
 
481 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000910554  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0724  monooxygenase, FAD-binding  40.92 
 
 
461 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0962  putative monooxygenase, FAD-binding  35.21 
 
 
574 aa  196  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0576419  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3345  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 
505 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0779  monooxygenase, FAD-binding  34.86 
 
 
500 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal  0.655211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2324  monooxygenase FAD-binding  34.75 
 
 
547 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.261518  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3048  hypothetical protein  40.41 
 
 
506 aa  193  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3267  monooxygenase FAD-binding  38.19 
 
 
486 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2645  FAD-binding monooxygenase, PheA/TfdB family  37.64 
 
 
529 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0393426  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2368  monooxygenase FAD-binding  35.13 
 
 
549 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128155  normal  0.778169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1172  monooxygenase, FAD-binding  37.43 
 
 
535 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1620  pentachlorophenol 4-monooxygenase; PcpB  34.1 
 
 
548 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168334  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0550  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 
548 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1029  monooxygenase, FAD-binding  35.37 
 
 
548 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.594814  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0988  monooxygenase FAD-binding  35.11 
 
 
548 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622027  normal  0.120457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0417  monooxygenase FAD-binding  38.2 
 
 
501 aa  189  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5009  monooxygenase, FAD-binding  33.4 
 
 
506 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2377  hypothetical protein  37.93 
 
 
553 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.879652  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4142  monooxygenase, FAD-binding  34.96 
 
 
546 aa  183  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372966  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0905  monooxygenase FAD-binding  35.81 
 
 
550 aa  183  7e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.147157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3421  monooxygenase FAD-binding protein  34.96 
 
 
388 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.0698914 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0893  monooxygenase, FAD-binding  36.48 
 
 
550 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207082  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3025  monooxygenase FAD-binding  32.76 
 
 
574 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.114894  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1717  hypothetical protein  32.41 
 
 
502 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.587948  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1860  hypothetical protein  39.33 
 
 
498 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267805  normal  0.600833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1624  hypothetical protein  32.21 
 
 
502 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.459087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2135  monooxygenase FAD-binding  34.18 
 
 
540 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218617  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1650  hypothetical protein  32.39 
 
 
502 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1658  hypothetical protein  31.82 
 
 
502 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6396  monooxygenase FAD-binding  33.99 
 
 
511 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.572405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6034  monooxygenase FAD-binding protein  36.53 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.829011  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5043  monooxygenase, FAD-binding  32.93 
 
 
505 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483306  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>