More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1492 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  100 
 
 		 575 aa  1104    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  59.4 
 
 		 517 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  51.72 
 
 		 562 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  52.74 
 
 		 521 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  53.85 
 
 		 501 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  54.38 
 
 		 529 aa  451  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  56.11 
 
 		 509 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  51.61 
 
 		 526 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  47.77 
 
 		 528 aa  429  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  48.81 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  53.46 
 
 		 496 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  50.2 
 
 		 601 aa  403  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  51.17 
 
 		 513 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  49.51 
 
 		 528 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  53.99 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 558 aa  404  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  45.63 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 584 aa  392  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 509 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  49.02 
 
 		 588 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.4 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 		 553 aa  379  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  49.69 
 
 		 540 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  52.59 
 
 		 502 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  51.2 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.26 
 
 		 537 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  46.42 
 
 		 536 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  47.04 
 
 		 554 aa  359  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  49.15 
 
 		 506 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  50.69 
 
 		 513 aa  355  1e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 535 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 541 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  43.99 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 533 aa  350  6e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  49.69 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  43.06 
 
 		 508 aa  347  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  45.31 
 
 		 516 aa  346  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 		 516 aa  340  2.9999999999999998e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  45.96 
 
 		 555 aa  340  4e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  44.88 
 
 		 505 aa  335  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 		 528 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.94 
 
 		 513 aa  332  8e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 477 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  44.91 
 
 		 508 aa  329  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 519 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.15 
 
 		 535 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 524 aa  326  7e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 514 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 497 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  44.09 
 
 		 517 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  41.45 
 
 		 503 aa  308  3e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  47.05 
 
 		 536 aa  304  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 517 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  44.95 
 
 		 528 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.84 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 511 aa  282  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  38.22 
 
 		 490 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  40.13 
 
 		 492 aa  279  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 516 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  37.7 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  40.19 
 
 		 503 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 500 aa  252  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 500 aa  250  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.85 
 
 		 500 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.81 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 504 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.94 
 
 		 538 aa  240  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  38.32 
 
 		 594 aa  233  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  41.73 
 
 		 511 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  37.92 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.26 
 
 		 522 aa  229  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  37.92 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  37.7 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.77 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  37.92 
 
 		 495 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  37.92 
 
 		 495 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 514 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  36.57 
 
 		 494 aa  225  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.51 
 
 		 607 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 506 aa  223  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.5 
 
 		 519 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1946  putative MFS transporter  35.66 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.55 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  35.97 
 
 		 501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 501 aa  213  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 519 aa  211  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.56 
 
 		 626 aa  210  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  36.2 
 
 		 523 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>