More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1485 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  96.94 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  78.44 
 
 		 222 aa  346  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  70.42 
 
 		 218 aa  297  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  68.9 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  71.43 
 
 		 223 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  68.35 
 
 		 219 aa  293  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  68.54 
 
 		 217 aa  291  6e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  69.63 
 
 		 218 aa  291  6e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  69.52 
 
 		 219 aa  289  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  68.06 
 
 		 220 aa  287  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  66.82 
 
 		 233 aa  281  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  65.75 
 
 		 221 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  63.47 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  63.47 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  63.47 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  63.47 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  64.22 
 
 		 231 aa  266  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  65.2 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  61.64 
 
 		 219 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  58.15 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  63.41 
 
 		 220 aa  265  5e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  65.57 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  58.02 
 
 		 224 aa  254  6e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  57.4 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  56.73 
 
 		 225 aa  250  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  58.94 
 
 		 241 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  53.25 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0745  TrkA domain-containing protein  51.95 
 
 		 231 aa  240  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  51.57 
 
 		 299 aa  229  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  50.93 
 
 		 253 aa  228  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  48 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  49.78 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2875  TrkA-N domain protein  49.78 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  46.33 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  39.32 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  37.33 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  35.43 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  38.28 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  35.51 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  30.14 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  29.82 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  29.36 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  28.96 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  33.95 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  30.29 
 
 		 221 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  31.51 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  32.84 
 
 		 215 aa  102  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 221 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  32.14 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  27.85 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  27.78 
 
 		 457 aa  94.7  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.31 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  30.66 
 
 		 449 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  30.64 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 221 aa  91.7  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 		 445 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2622  potassium transporter peripheral membrane component  32.52 
 
 		 458 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637696 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0088  potassium transporter peripheral membrane component  27.4 
 
 		 462 aa  89.4  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  31.36 
 
 		 443 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  26.34 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0052  potassium transporter peripheral membrane component  30.99 
 
 		 457 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0020  potassium transporter peripheral membrane component  32.52 
 
 		 457 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0014  potassium transporter peripheral membrane component  31.31 
 
 		 458 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00830339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  28.81 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00140  potassium transporter peripheral membrane component  30.52 
 
 		 457 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.35944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0180  Trk system potassium uptake protein TrkA  33.33 
 
 		 457 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  31.6 
 
 		 459 aa  86.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  32.5 
 
 		 630 aa  86.3  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0018  potassium transporter peripheral membrane component  30.52 
 
 		 477 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.265003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4126  potassium transporter peripheral membrane component  28.95 
 
 		 458 aa  85.9  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00170  potassium transporter peripheral membrane component  31.46 
 
 		 457 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  30.85 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.59 
 
 		 225 aa  85.1  8e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1062  TrkA-N domain-containing protein  35 
 
 		 445 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.121384  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0065  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.948816  unclonable  0.000000448887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685696  normal  0.107342 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0201  potassium transporter peripheral membrane component  31.75 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0211158  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  30.13 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  28.16 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0081  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.242422  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0017  potassium transporter peripheral membrane component  30.99 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 		 628 aa  84  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0084  potassium transporter peripheral membrane component  30.05 
 
 		 457 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.409393  hitchhiker  0.00000000549949 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3020  potassium transporter peripheral membrane component  30.1 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  30.32 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0769  TrkA-N domain protein  34.42 
 
 		 445 aa  82.4  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.601936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0016  potassium transporter peripheral membrane component  29.58 
 
 		 457 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  31.53 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  29.55 
 
 		 467 aa  81.6  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  32.72 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.88 
 
 		 448 aa  80.9  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  30.94 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2872  potassium transporter peripheral membrane component  31.73 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>