More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1470 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  93.17 
 
 		 293 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  49.15 
 
 		 297 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  48.47 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  48.81 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  46.67 
 
 		 314 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  46.98 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  48.12 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  43.24 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  46.18 
 
 		 288 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  44.63 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  46.76 
 
 		 287 aa  159  7e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  40.53 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  34.65 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  37.25 
 
 		 320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  40.75 
 
 		 312 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0752  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 310 aa  99.4  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  23.81 
 
 		 338 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  34.53 
 
 		 338 aa  92.4  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1706  PfkB domain protein  28.08 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  36.7 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  30.43 
 
 		 407 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  23.44 
 
 		 333 aa  89.7  6e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  32.71 
 
 		 333 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 		 320 aa  88.2  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  31.6 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 341 aa  85.9  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 		 337 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  23.34 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  30.94 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  23.6 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.03 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 305 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  28.97 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  31.02 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  27.72 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  30.92 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  26.77 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  33.55 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  32.31 
 
 		 318 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  32.06 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.08 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  32.61 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  30.92 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  34.78 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.01 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.78 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.78 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3692  PfkB domain protein  36.63 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  26.61 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  28 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  27.95 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  32.13 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  31.13 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4060  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  33.82 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  30.65 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  30.45 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  31.27 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.89 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2014  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  31.68 
 
 		 331 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  29.22 
 
 		 325 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  32.79 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 330 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  31.31 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  32.59 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0187  PfkB domain protein  33.1 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  31.11 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>