47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1440 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0941  hypothetical protein  72.46 
 
 		 472 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15053  normal  0.447115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1440  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  908    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.1984  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1208  protein of unknown function DUF690  39 
 
 		 481 aa  247  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2228  hypothetical protein  37.53 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359411  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0477  hypothetical protein  35.89 
 
 		 479 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0396  hypothetical protein  32.64 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.290872  normal  0.769323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4839  hypothetical protein  36.58 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000509999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3150  protein of unknown function DUF690  35.38 
 
 		 488 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0609  protein of unknown function DUF690  34.16 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0986  hypothetical protein  33.62 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8088  hypothetical protein  34.1 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8476  protein of unknown function DUF690  34.51 
 
 		 470 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8522  protein of unknown function DUF690  31.06 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.013435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0674  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.957662  normal  0.340047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4812  protein of unknown function DUF690  32.02 
 
 		 459 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0399688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0412  hypothetical protein  28.39 
 
 		 510 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218055 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13487  hypothetical protein  30.7 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0376841  normal  0.0257137 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1444  hypothetical protein  28.76 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3203  protein of unknown function DUF690  29.34 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.161915 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5778  hypothetical protein  27.45 
 
 		 505 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981226  normal  0.352766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3295  protein of unknown function DUF690  29.51 
 
 		 496 aa  111  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.061282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0328  hypothetical protein  26.26 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0953892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3367  protein of unknown function DUF690  30.43 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6576  protein of unknown function DUF690  25.66 
 
 		 540 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0690  hypothetical protein  25.49 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.335063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5959  hypothetical protein  25.83 
 
 		 504 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5556  hypothetical protein  25.83 
 
 		 504 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13930  hypothetical protein  27.63 
 
 		 495 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.906406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10290  hypothetical protein  26.26 
 
 		 538 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.225236  normal  0.597294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7885  protein of unknown function DUF690  27.29 
 
 		 465 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0519943  normal  0.0107564 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11813  hypothetical protein  25.2 
 
 		 506 aa  87  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4962  hypothetical protein  29.41 
 
 		 453 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0065  hypothetical protein  26.95 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0055  hypothetical protein  26.95 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00921629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0074  hypothetical protein  26.95 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0381  hypothetical protein  30.3 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0371  hypothetical protein  30.3 
 
 		 516 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0772  hypothetical protein  27 
 
 		 493 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0360  hypothetical protein  29.87 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13904  hypothetical protein  27.03 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.784362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1150  hypothetical protein  29.98 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.431987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1140  hypothetical protein  29.98 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1123  hypothetical protein  29.98 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0073  hypothetical protein  27.07 
 
 		 495 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0449137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04350  Protein of unknown function (DUF690)  24.02 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5462  hypothetical protein  25.76 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0308  hypothetical protein  35.93 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00549191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>