More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1418 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  92.37 
 
 		 252 aa  450  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.88 
 
 		 244 aa  259  3e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 233 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.08 
 
 		 240 aa  252  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  56.7 
 
 		 233 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  57.27 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.06 
 
 		 239 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  56.7 
 
 		 234 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 		 239 aa  241  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  48.13 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.02 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  55.65 
 
 		 238 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.22 
 
 		 241 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  56.7 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.08 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.3 
 
 		 243 aa  237  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.4 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.97 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  55.51 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  55.36 
 
 		 236 aa  236  3e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  54.87 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  48.96 
 
 		 243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.78 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  55.31 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.86 
 
 		 236 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  53.42 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  52.36 
 
 		 239 aa  231  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  53.74 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.34 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.86 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.02 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.8 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  51.57 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  52.32 
 
 		 242 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.58 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.25 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  50.45 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  53.15 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 406 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  53.39 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  49.12 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.47 
 
 		 229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  50.22 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  52.7 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.26 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 246 aa  211  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.67 
 
 		 243 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  45.35 
 
 		 257 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.7 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2336  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.019228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 231 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0844  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000660959  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  37.95 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.42 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 239 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  38.29 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  168  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.61 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.56 
 
 		 224 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 228 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  37.84 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>